conda是用來進(jìn)行創(chuàng)建虛擬環(huán)境用的，不是分析軟件，分析使用的CellphoneDB，畫圖通訊圈圖是用的R語言的igraph包
CellPhoneDB背景 受配體介導(dǎo)的細(xì)胞之間的通訊分析對于協(xié)調(diào)發(fā)育、分化和炎癥等多種生物學(xué)過程至關(guān)重要。CellPhoneDB是一個(gè)受配體及其相互作用的數(shù)據(jù)庫，有別于其他數(shù)據(jù)庫的是CellPh...
背景 受配體介導(dǎo)的細(xì)胞之間的通訊分析對于協(xié)調(diào)發(fā)育、分化和炎癥等多種生物學(xué)過程至關(guān)重要。CellPhoneDB是一個(gè)受配體及其相互作用的數(shù)據(jù)庫，有別于其他數(shù)據(jù)庫的是CellPh...
上一章我們介紹了有關(guān)于scATAC-seq的相關(guān)內(nèi)容，包括scATAC-seq的優(yōu)缺點(diǎn)、分析軟件已經(jīng)分析方法的介紹。從本章開始，開始介紹使用ArchR來進(jìn)行scATAC-se...
大佬你好，單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組對生物學(xué)重復(fù)有什么要求嗎
Seurat?4.0 ||單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析工具箱有更新隨著單細(xì)胞技術(shù)的成熟，同一細(xì)胞內(nèi)的信息越來越多被揭曉。在轉(zhuǎn)錄組時(shí)代，我們說單細(xì)胞是一個(gè)rna的盒子，細(xì)胞類型是基因特異性表達(dá)的結(jié)果。現(xiàn)在，我們可以說單細(xì)胞是中心法則的反應(yīng)器，...
你好，在現(xiàn)在官網(wǎng)的數(shù)據(jù)的時(shí)候下載不下來要怎么辦，能手動(dòng)下載下來在加載嗎？如果可以的話，要怎么加載，謝謝。
細(xì)胞類型鑒定|| 你要的SingleR教程，一本書夠不夠An ancient interdimensional horror who has recently awoken from his aeons-long slumber....
你好，你的各種數(shù)據(jù)庫下載的時(shí)候有障礙嗎，我這邊的數(shù)據(jù)庫各種下載不下來，有沒有手動(dòng)加載數(shù)據(jù)庫的方法
學(xué)習(xí)對scRNA-seq數(shù)據(jù)注釋的R包SingleRUsing SingleR to annotate single-cell RNA-seq data 參考：https://www.bioconductor.org/pack...
@三班最帥體委 你解決了嗎，我也遇到同樣的問題了
10X單細(xì)胞測序分析軟件:Cell ranger單細(xì)胞測序有著漫長的過去，卻只有短暫的歷史---誰說的！ 說她漫長是因?yàn)榈饺缃褚灿惺畮啄甑臍v史了，說她段短暫是因?yàn)獒槍渭?xì)胞的分析工具越來越有意義開發(fā)周期卻越來越短。一般生物...
