rosalind是一個(gè)生信學(xué)習(xí)網(wǎng)站(網(wǎng)址為[http://rosalind.info/problems/list-view/]),上面有許多生物信息相關(guān)的題目,用python...
data() #查看datasets包中的數(shù)據(jù)集 data(package = "ggplot2")# 加載ggplot2包中的數(shù)據(jù)集
人是一個(gè)非常的視覺動(dòng)物,當(dāng)你有一個(gè)結(jié)果的時(shí)候,一個(gè)好的展示更加能夠讓人接受。分享一些繪圖 散點(diǎn)圖 最常見的圖可能就是散點(diǎn)圖了: 在呈現(xiàn)結(jié)果時(shí),有時(shí)我會(huì)在圖表中包圍某些特殊的點(diǎn)...
Tips:orthofinder 提供了dendroblast 或 msa的方式去構(gòu)建基因家族樹,可以使用-M開啟-M msa -A muscle -T iqtree ,默認(rèn)...
劉小澤寫于19.2.11 這是干啥的? 做進(jìn)化、基因家族分析、比較基因組使用 OrthoFinder is simple to use and all you need to...
最近Orthofinder2開始陸續(xù)更新,文章已經(jīng)投發(fā)到biorkix上,在網(wǎng)上搜了一圈,關(guān)于Orthofinder的使用的中文教程幾乎是空白的,這周就借此機(jī)會(huì)和大家一起來學(xué)...
基因組共線性工具M(jìn)CScanX使用說明 簡(jiǎn)介 MCScanX工具集對(duì)MCScan算法進(jìn)行了調(diào)整,用于檢測(cè)共線性和同線性區(qū)域,還增加了可視化和下游分析。。MCscanX有三個(gè)核...
MCScanX是檢測(cè)基因共線性和進(jìn)化分析的常用工具之一,2012發(fā)表至今引用數(shù)200+,作者之一的唐海寶老師是國內(nèi)植物基因組學(xué)生信分析、軟件開發(fā)領(lǐng)域的大拿,在學(xué)習(xí)使用MCSc...
一、tr 命令 tr (translate) 命令可以對(duì)來自標(biāo)準(zhǔn)輸入的字符進(jìn)行替換、壓縮和刪除操作。 語法 選項(xiàng) tr string1 string2 :將標(biāo)準(zhǔn)輸入中所有屬于...
awk命令去重,sort, uniq命令去重統(tǒng)計(jì) 利用Linux命令行進(jìn)行文本按行去重并按重復(fù)次數(shù)排序 linux命令行提供了非常強(qiáng)大的文本處理功能,組合利用linux命令能...