文獻(xiàn)信息 標(biāo)題：Benchmarking of shotgun sequencing depth reveals the potential and limitations ...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：陜西
-
文獻(xiàn)解讀：鳥(niǎo)槍法宏基因組測(cè)序深度基準(zhǔn)測(cè)試：淺層宏基因組學(xué)與菌株水平分析的潛力與局限
-
Microbiome|來(lái)自北極和大西洋的浮游植物微生物組的宏基因組組裝背景 浮游植物群在全球生物地球化學(xué)循環(huán)中發(fā)揮重要作用，是海洋食物網(wǎng)的基礎(chǔ)。雖然通過(guò)全球范圍的元基因組探測(cè)對(duì)它們的未培養(yǎng)基因組多樣性進(jìn)行了估計(jì)，但這種方法尚未估算復(fù)雜度的極地和...
-
NatureCommunications|國(guó)沿海泥灘潮間帶病毒組的生物多樣性研究 (一)背景 潮間帶的海灘生態(tài)系統(tǒng)是病毒活動(dòng)的場(chǎng)所，具有顯著的生態(tài)價(jià)值和復(fù)雜的生物多樣性重要。然而，目前關(guān)于潮間帶區(qū)域病毒多樣性的研究尚不充分，尤其是在功能基因和病毒方面-簡(jiǎn)單方面缺...
-
Microbiome|宏基因組學(xué)揭示全球食品發(fā)酵中次級(jí)調(diào)用物生物合成潛力的棲息地背景 發(fā)酵食品在人類改善健康方面受到廣泛認(rèn)可，衍生出豐富的多種豐富的營(yíng)養(yǎng)成分和生物活性物質(zhì)。這些食品中重要的代謝物是由生物合成基因簇（BGCs）決定的，具有抗菌、然而，全球食...
-
NatureMedicine|早期生命破壞破壞組的32277個(gè)基因組和超過(guò)8000萬(wàn)個(gè)基因組背景 人類破壞破壞組在第一健康和疾病中著眼作用，尤其是在生命早期。高質(zhì)量的參考基因組對(duì)破壞破壞組的分類、重要功能特征分析至關(guān)重要。本研究通過(guò)分析來(lái)自3歲以下兒童的6122個(gè)模...
-
NatureCommunications|在粘蛋白水凝膠載體中培養(yǎng)復(fù)雜的腸道微生物群落背景 環(huán)境微生物組在首先健康和疾病中發(fā)揮重要作用，尤其是在破壞破壞組的研究中。然而，關(guān)于微生物組在不同環(huán)境中的空間組織調(diào)節(jié)以及這些組織的基因的了解仍然有限。研究通過(guò)建立一個(gè)包...
-
Linux 中多任務(wù)寫入同一文件解決辦法
背景 二代宏基因組分析的自動(dòng)化流程的對(duì)數(shù)據(jù)質(zhì)控處理階段，在宏基因組的分析中，樣本可能會(huì)存在宿主污染的情況，這時(shí)候需要對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行去宿主的操作，操作的方法就是用bowtie2軟件...
-
樣本與抗性基因Circos圖片解讀背景 高分文章的圖片看不懂？高分文章的圖片好好看！這里對(duì)文章中常見(jiàn)的花里胡哨的Circos圖進(jìn)行仔細(xì)解讀，希望開(kāi)拓大家對(duì)高分文章中圖片解讀的思路，拋磚引玉一下啦~ 圖片繪制 ...
-
NCBI里的SRA數(shù)據(jù)如何下載？
NCBI的序列讀取檔案（SRA，Sequence Read Archive）是一個(gè)公共存儲(chǔ)庫(kù)，包含了大量的高通量序列數(shù)據(jù)。你可以通過(guò)多種方法下載SRA數(shù)據(jù)。以下是一些常見(jiàn)的方...