1、通過KEGGREST包來探索KEGG數(shù)據(jù)庫的12大代謝通路 通過觀察KEGG官網(wǎng) ：https://www.genome.jp/kegg/pathway.html[htt...
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IP屬地：黑龍江
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R獲取KEGG/GO中某一通路所有基因 -
單細(xì)胞譜系分化高級算法2021.02.14今天收集了三個與譜系分化有關(guān)的單細(xì)胞高級算法：MAGIC（2018 Cell），PHATE（2019 NBT），Palantir（2019 NBT）。它們...
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利用貝葉斯的方法獲得cell cluster的marker基因
理論 參考文章為：genesorteR[https://www.biorxiv.org/content/10.1101/676379v2.full]簡單理解下，每個cell ...
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利用Seurat包Transfer數(shù)據(jù)集（FindTransferAnchors和TransferData）2022-6-09關(guān)鍵詞 FindTransferAnchors函數(shù) TransferData函數(shù) 細(xì)胞類型注釋 映射數(shù)據(jù)集/Transfer 數(shù)據(jù)集 適用背景 細(xì)胞注釋的標(biāo)準(zhǔn)一直備受爭議，就...
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10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）巨噬細(xì)胞分析之M1/M2分型討論
hello,大家好，周三了，一周又要過去了，時間真的是過得飛快，根本來不及反應(yīng)，真的是一寸光陰一寸金，寸金難買寸光陰~~~ 今天分享一個小的知識點(diǎn)，單細(xì)胞關(guān)于巨噬細(xì)胞分析的常...
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使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖單細(xì)胞繪圖系列： Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.itdecent.cn/p/95e61f7e834d] Seurat是分析單細(xì)胞數(shù)據(jù)一個非常好用的包，自帶...
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Bootstrap 1 介紹Bootstrap 是一種常用的統(tǒng)計手段， 本文主要介紹一下 Boostrap 是什么東西，以及它的優(yōu)點(diǎn)。 內(nèi)容參考自油管視頻 StatQuest Bootstrap[ht...
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ggplot2如何在多個圖像之間使用統(tǒng)一的配色
當(dāng)使用ggplot2構(gòu)建多個圖片但是需要其中的元素使用統(tǒng)一的配色方案可以參考如下方案進(jìn)行： 設(shè)置一個帶有name的向量，之后使用scale_colour_manual(val...
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pheatmap如何更改橫縱坐標(biāo)標(biāo)簽的顏色
pheatmap是一個功能十分強(qiáng)大的R包，在繪制熱圖方面十分的便利，但是該包沒有提供修改熱圖橫縱坐標(biāo)標(biāo)簽顏色的方法，如果想要更改顏色可以參考如下的策略： 此教程參考： htt...
