ln失敗 具體表現(xiàn)為 ln: failed to create symbolic link 'lh.white.H': Operation not permitted可能的原...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
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運(yùn)行FreeSurfer的時(shí)候踩過(guò)的坑
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ADNI多模態(tài)神經(jīng)影像整理筆記目標(biāo)：將ADNI下載的多模態(tài)格式影像轉(zhuǎn)為BIDS存儲(chǔ)格式的NIFTI文件環(huán)境：Ubuntu 2020工具包： 1. 下載影像 官網(wǎng)：https://ida.loni.usc....
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@SaIt 用ggseg吧，這個(gè)太繁瑣了
使用Workbench對(duì)基于BNA246模板的統(tǒng)計(jì)結(jié)果進(jìn)行surface可視化
1. 背景 之前都是用matlab的BrainNet Viewer做可視化的，無(wú)奈BNV的bug實(shí)在太多了，并且volume畫(huà)出來(lái)腦區(qū)上還動(dòng)不動(dòng)出現(xiàn)黑邊...需要一款替代軟件...
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@無(wú)厘頭_d8fe 設(shè)置里可以調(diào)
使用Workbench對(duì)基于BNA246模板的統(tǒng)計(jì)結(jié)果進(jìn)行surface可視化
1. 背景 之前都是用matlab的BrainNet Viewer做可視化的，無(wú)奈BNV的bug實(shí)在太多了，并且volume畫(huà)出來(lái)腦區(qū)上還動(dòng)不動(dòng)出現(xiàn)黑邊...需要一款替代軟件...
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【R和python】把for-loop改并行
把循環(huán)改成并行可以顯著提升代碼運(yùn)行效率 R語(yǔ)言 借助furrr和future包 Python 借助concurrent.futures包把需要遍歷的元素放在 element_...
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FSL-eddy應(yīng)用于不同采集方式下的擴(kuò)散磁共振影像預(yù)處理eddy命令可以矯正dMRI的頭動(dòng)（顧名思義）和渦流矯正（糾正渦流引起的扭曲和主體的運(yùn)動(dòng)），是dMRI預(yù)處理中的一個(gè)常用工具。詳細(xì)介紹可以看https://fsl.fmrib...
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R - 一行代碼從向量中生成兩兩組合并且生成tibble應(yīng)用場(chǎng)景：一共8個(gè)子網(wǎng)絡(luò)，生成兩個(gè)子網(wǎng)絡(luò)之間的連接強(qiáng)度. mod.label = c('SUB', 'VN', 'SMN', 'DAN', 'VAN', 'LM', 'FPN...
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@e5d70581332d 有空的時(shí)候?qū)憣?xiě)
FSL-BIANCA的使用例子
BIANCA是Brain Intensity AbNormality Classification Algorithm的縮寫(xiě)，主要用來(lái)算WMH BIANCA is a ful...
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使用Workbench對(duì)基于BNA246模板的統(tǒng)計(jì)結(jié)果進(jìn)行surface可視化1. 背景 之前都是用matlab的BrainNet Viewer做可視化的，無(wú)奈BNV的bug實(shí)在太多了，并且volume畫(huà)出來(lái)腦區(qū)上還動(dòng)不動(dòng)出現(xiàn)黑邊...需要一款替代軟件...
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matlab太奇葩了，還是用R語(yǔ)言方便（這類問(wèn)題用ggplot做熱點(diǎn)圖就可以了）
使用imagesc同時(shí)保存多張圖的方法
matlab的imagesc函數(shù)可以把csv生成矩陣圖 當(dāng)一個(gè)文件夾下有多個(gè)csv時(shí)，可以寫(xiě)個(gè)腳本進(jìn)行批量處理，如下提供了兩種方案 1. 同時(shí)彈出多個(gè)影像 會(huì)在運(yùn)行結(jié)束時(shí)彈出...
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Matlab 把矩陣的結(jié)構(gòu)體保存成單獨(dú)的txtMatlab小白，matlab彎彎繞繞太多了用DCP跑完腦網(wǎng)絡(luò)通常是.mat格式的【雙擊導(dǎo)入mat到工作區(qū)就可以了】 為了方便后續(xù)用R或者python處理需要把它們保存成一個(gè)...
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@睿捷醫(yī)生 謝謝！
R - mediation package的使用
關(guān)于中介分析的介紹，可以參考這個(gè)帖子 Reference mediation: R Package for Causal Mediation Analysis mediati...
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將大量的文件平均分配到子文件夾下的python代碼
應(yīng)用舉例：有10000個(gè)表格文件（都用規(guī)則的名稱命名，但是有的編號(hào)可能有遺漏），平均分配給n個(gè)人如下的代碼可以自動(dòng)生成子文件夾（sub1，sub2，。。。，subn）
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使用imagesc同時(shí)保存多張圖的方法matlab的imagesc函數(shù)可以把csv生成矩陣圖 當(dāng)一個(gè)文件夾下有多個(gè)csv時(shí)，可以寫(xiě)個(gè)腳本進(jìn)行批量處理，如下提供了兩種方案 1. 同時(shí)彈出多個(gè)影像 會(huì)在運(yùn)行結(jié)束時(shí)彈出...
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在服務(wù)器上運(yùn)行matlab腳本
假設(shè)pathA下面有一個(gè)待運(yùn)行的B.m注意在命令行下運(yùn)行的matlab腳本需要在末尾添加exit語(yǔ)句 方法一 方法二
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十分鐘學(xué)習(xí) mac+chrome 常用快捷鍵沒(méi)想到之前寫(xiě)的學(xué)習(xí)計(jì)劃，有人點(diǎn)了喜歡文章，竟然還關(guān)注了我說(shuō)謝謝，那我干脆把自己學(xué)習(xí)過(guò)程中遇到的收獲和問(wèn)題寫(xiě)下來(lái)大家隨便看看，能有所幫助就更好啦~ windows剛換mac的時(shí)...
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如何進(jìn)行peer-review?
你要知道進(jìn)行審稿的你正在扮演人類知識(shí)庫(kù)守門員的重要角色 一般步驟[https://www.youtube.com/watch?v=LnZd6q-5lg8] 下載并通讀整篇文章...
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R語(yǔ)言與醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)圖形-【2】散點(diǎn)圖、盒形圖R語(yǔ)言基礎(chǔ)繪圖系統(tǒng) 基礎(chǔ)圖形——散點(diǎn)圖、盒形圖 plot是一個(gè)泛型函數(shù)（generic method），對(duì)于不同的數(shù)據(jù)繪制不同的圖形。 par函數(shù)的大部分參數(shù)在plot中通用...
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R語(yǔ)言-相關(guān)系數(shù)計(jì)算(一)應(yīng)用R語(yǔ)言完成相關(guān)性檢驗(yàn)，相關(guān)性矩陣及相關(guān)性可視化首先安裝相應(yīng)的R包 相關(guān)性分析的方法Pearson correlation，屬于最常用的一種，用于計(jì)算兩個(gè)變量之間的線下相關(guān)...