1. Seurat對(duì)象查看當(dāng)前的Assay 在進(jìn)行了SCTransform操作后，矩陣默認(rèn)會(huì)變成SCT矩陣，如果不加設(shè)置，后續(xù)的PCA等操作都是基于SCT矩陣。修改Defau...
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)處理小細(xì)節(jié)匯總 -
單細(xì)胞系列課程-10 Trajectory inference analysis of scRNA-seq data視頻鏈接：https://www.youtube.com/watch?v=XmHDexCtjyw&list=PLjiXAZO27elC_xnk7gVNM85I2IQl5BEJ...
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單細(xì)胞空間數(shù)據(jù)分析人類胚胎肺細(xì)胞異質(zhì)性的發(fā)育起源作者，Evil Genius 好了，開始這篇的內(nèi)容。 文章信息A topographic atlas defines developmental origins of cel...
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Python單細(xì)胞復(fù)現(xiàn)2022||01-文獻(xiàn)閱讀：致命COVID-19分子單細(xì)胞肺圖譜這篇文獻(xiàn)提供的代碼是R與python版本，是個(gè)極好的學(xué)習(xí)單細(xì)胞與python的資源 今天先來看看文獻(xiàn)背景 文獻(xiàn)情況： 標(biāo)題：A molecular single-cell l...
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時(shí)空組學(xué)信號(hào)流與臨床信息作者，追風(fēng)少年i~~ 前段時(shí)間回家，幾天沒有更新，馬上中秋節(jié)就要到了，希望跟我一樣在外的游子多回家看看，緣分到了就早點(diǎn)成家吧，人生沒有倒帶，唯有前進(jìn)才是真理。 這一篇文章繼續(xù)...
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10X空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之細(xì)胞類型與生物學(xué)通路的空間依賴性作者，追風(fēng)少年i 新的一周，新的開始，接上一篇，10X空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之細(xì)胞的空間依賴性[http://www.itdecent.cn/p/1877c6688948]，這...
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單細(xì)胞個(gè)性化分析之軌跡分析篇作者，追風(fēng)少年i 隨著單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的飛速發(fā)展和相應(yīng)分析工具的大量出現(xiàn)，單細(xì)胞測(cè)序的應(yīng)用逐漸走向成熟，能解決的生物學(xué)問題也越來越廣泛。而其中，軌跡分析（擬時(shí)分析）是單細(xì)胞分析...
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MISTy：空間轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞互作分析方法1. 簡介 MISTy主要有四個(gè)功能： 算法：Multi-view framework to dissect effects related to CCI (剖析與細(xì)胞-細(xì)胞...
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10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）通訊分析之總結(jié)Nichenet多條件差異通訊作者，追風(fēng)少年i 周三了，好好學(xué)習(xí)，天天搬磚，人生沒有倒帶，前進(jìn)才是真理 接上一篇，10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）通訊分析之總結(jié)Nichenet生態(tài)位通訊比較分析[http...
