本文章將介紹 ①類blast軟件blast、mmseqs、diamond、hmmer的比較 ②blast、mmseqs、diamond、hmme...
基本原理 首先放一張各大網(wǎng)站用爛的圖 KNN的基本思想是比較簡單的,就是假設我們有紅色和藍色得到數(shù)據(jù)點,然后我們新加入一個綠色點,根據(jù)綠色點最近...
數(shù)學原理簡要說明 基本原理 PCA所做的事情實際上是將多維的數(shù)據(jù)降維到一個更低的維度,但同時保證數(shù)據(jù)之間盡可能的分開,而衡量這個分散程度的標準就...
背景 手頭有KEGG對應各個基因的注釋文件(注釋可以參考KAAS注釋流程),但沒有對應的KO號,需要得到相應的KO號做富集分析 Python s...
Introduction 此課程是Coursera上,John Hopkins University 的 Genomic Data Scienc...
Introduction Galaxy是一個公開的基因組學分析平臺,包含了一系列流程化分析工具,針對質(zhì)控、組裝、注釋以及包括Chip-seq、R...
課程頁面 右上角是我google賬戶名稱 地址: 這個第一個課,Data Science那邊可以著重了解下,其他沒什么太大的重要性。 順便說下,...
近幾年來,Hyphy的使用人數(shù)越來越來多,雖然不及paml,但這款軟件的一些優(yōu)秀特性使得它值得受到使用和關注。首先相比paml,hyphy有以下...
問題背景 大致是這樣,假如你用一堆注釋軟件然后用不同物種得到了一堆不同的gff,那這些gff肯定是有重疊的,對于注釋信息gff來說只需要保留ge...