這說明,你的NMDS不具代表性,你可以換一種方法,比如PCA,PCoA。此外,可以結(jié)合anosim來分析組間差異
非度量多維尺度(NMDS)分析及R繪圖先上圖 注:填充顏色由AI處理。 (樣本和分組文件如下)(這里只是展示數(shù)據(jù)形式并不是原數(shù)據(jù)(分組名與代碼中不一樣)) vegan分析數(shù)據(jù) 行名樣本,列名物種,內(nèi)容豐度。 繪圖...
這說明,你的NMDS不具代表性,你可以換一種方法,比如PCA,PCoA。此外,可以結(jié)合anosim來分析組間差異
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@7a1ff93ad00b 你對應(yīng)你的分組名稱修改一下,顏色按照哪個組區(qū)分,形狀按照哪個組區(qū)分
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@Bluebagae 沒區(qū)別,只要你的otu表格行名(樣本名)和group行名一樣就可以了
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首先準(zhǔn)備數(shù)據(jù)和分組文件 形式如下: 輸出文件如下 其他相關(guān)代碼(對各個位置不同深度或各深度不同位置進行LSD) 輸出文件如下
具體的找不到了,我發(fā)了個類似的哈哈哈哈
非度量多維尺度(NMDS)分析及R繪圖先上圖 注:填充顏色由AI處理。 (樣本和分組文件如下)(這里只是展示數(shù)據(jù)形式并不是原數(shù)據(jù)(分組名與代碼中不一樣)) vegan分析數(shù)據(jù) 行名樣本,列名物種,內(nèi)容豐度。 繪圖...
先上圖 注:填充顏色由AI處理。 (樣本和分組文件如下)(這里只是展示數(shù)據(jù)形式并不是原數(shù)據(jù)(分組名與代碼中不一樣)) vegan分析數(shù)據(jù) 行名樣本,列名物種,內(nèi)容豐度。 繪圖...
嗯嗯 謝謝大佬解答
宏基因組分箱(五)Metawrap計算Bin豐度導(dǎo)讀 用Metabat2分箱的方法見:宏基因組分箱(二)Metabat2分箱實戰(zhàn)[http://www.itdecent.cn/p/72a60906d9a7]。本篇將展示用...
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@恰童學(xué)少年 謝謝,宏基因組基因豐度和轉(zhuǎn)錄組的基因表達值計算方法差不多嗎?(我看很多軟件都是計算轉(zhuǎn)錄組基因的)
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這個可以用來計算預(yù)測基因的豐度嗎?一般基因的豐度怎樣計算的呀?跪求
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