比較基因組學(xué)分析目錄 1：單拷貝基因構(gòu)建物種樹以及計(jì)算分化時(shí)間[http://www.itdecent.cn/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收縮與擴(kuò)張分析[ht...
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比較基因組學(xué)分析2：基因家族收縮與擴(kuò)張分析 -
比較基因組學(xué)分析3：特異節(jié)點(diǎn)基因家族富集分析（非模式物種GO/KEEG富集分析）比較基因組學(xué)分析目錄 1：單拷貝基因構(gòu)建物種樹以及計(jì)算分化時(shí)間[http://www.itdecent.cn/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收縮與擴(kuò)張分析[ht...
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比較基因組學(xué)分析1：構(gòu)建單拷貝基因樹比較基因組學(xué)分析目錄 1：單拷貝基因構(gòu)建物種樹以及計(jì)算分化時(shí)間[http://www.itdecent.cn/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收縮與擴(kuò)張分析[ht...
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PASA（2.4.1）使用記錄
文章僅是記錄自己的學(xué)習(xí)使用，有錯(cuò)誤請(qǐng)指出，我立刻改正！ 官方說明：https://github.com/PASApipeline/PASApipeline/wiki[http...
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基于PASA進(jìn)行基因預(yù)測(cè)
PASA[http://pasa.sourceforge.net/], acronym for Program to Assemble** S**pliced Alignme...
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非模式生物重復(fù)序列注釋 RepeatModeler2+RepeatMasker4首先安裝RepeatModeler2,RepeatMasker4建議直接去官網(wǎng)下載，解壓安裝。同時(shí)安裝其他包。安裝流程這里不詳細(xì)介紹了，網(wǎng)上有很多。 假設(shè)現(xiàn)在已經(jīng)安裝完畢，并...
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基因組重復(fù)序列檢測(cè)：RepeatMasker的安裝及使用RepeatMasker是重復(fù)序列檢測(cè)的常用工具，通過與參考數(shù)據(jù)庫的相似性比對(duì)來準(zhǔn)確識(shí)別或屏蔽基因組中的重復(fù)序列，屬于同源預(yù)測(cè)注釋的方式。下文除了RepeatMasker的使...
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De novo組裝#03 | 基因組拼接（flye, wtdbg2, mecat2, canu）寫在前面 前面兩篇文章De novo組裝#01 | 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控（fasqc+fastp）[http://www.itdecent.cn/p/7c5447517de3] ...
