0.背景知識(shí) TCGA或TCGA+GTEx的表達(dá)矩陣，行名都是ensamble id，因?yàn)門CGA數(shù)據(jù)的參考基因組版本是genecode V22，xena重新分析的TCGA+...
IP屬地：遼寧
-
TCGA的ID轉(zhuǎn)換可以一步到位了
-
2020-11-15
和多個(gè)臨床特征相關(guān)聯(lián)的作圖，以均值作為比較項(xiàng) library(limma)library(ggpubr) expFile="TCGA_rpkm.txt" #表...
-
R數(shù)據(jù)可視化12:曼哈頓圖曼哈頓圖的名字來(lái)源是因?yàn)槠湫稳缏D的天際線：高聳在較低高度的“建筑物”上方的摩天大樓的輪廓。主要用于GWAS結(jié)果的展示，今天讓我們來(lái)看看如何繪制曼哈頓圖。 什么是曼哈頓圖 ...
-
GEO數(shù)據(jù)庫(kù)學(xué)習(xí)總結(jié)（三）ID轉(zhuǎn)換通過(guò)前面的數(shù)據(jù)下載，我們一般都可以得到如下矩陣，為了后續(xù)分析及文章需要，我們則需要吧探針名轉(zhuǎn)化為gene_symbol ID轉(zhuǎn)化主要分為二步 Ⅰ、得到探針一一對(duì)應(yīng)的基因名Ⅱ、...
