發(fā)現(xiàn)好多CNV calling 工具都好古早。。。安裝和試用時(shí)關(guān)于版本的問題調(diào)試比較多。。。所以想把自己遇到的報(bào)錯(cuò)貼出來，方便后人debug 1、 EXCAVATOR2 原理...
IP屬地：上海
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工具安裝及試用總結(jié)：對(duì)WES數(shù)據(jù)做germline的CNV calling（非癌癥的疾病研究）（未完。。。）
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DamID-seq分析筆記（一）pre: 盡量寫詳細(xì)點(diǎn)，方便理解 1：illumia機(jī)器測(cè)序的方向是3---->5,附上一張圖： 我是PE150測(cè)序，測(cè)序的adapter ：GATCG GAAGA拿到數(shù)據(jù)的...
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WGS分析筆記（7）—— 新的mapping工具開始之前特別感謝從美國“人肉背回”這兩個(gè)軟件的小伙伴！@Olivia阿儀_鴉雀 之前講過目前用的比較多的兩個(gè)二代測(cè)序基因組比對(duì)軟件，bwa 和 bowtie2，也比較了一下效...
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BLOSUM矩陣的推導(dǎo)
BLOSUM62是應(yīng)用得最廣的氨基酸替換矩陣，是BLAST中蛋白質(zhì)序列比對(duì)的默認(rèn)矩陣。 1. 如何下載替換計(jì)分矩陣 ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/...
個(gè)人介紹
復(fù)旦大學(xué)研究生在讀，方向：神經(jīng)疾病，基因組學(xué)，郵箱：shiyuant@outlook.com，文章完整系列個(gè)人主頁：tongshiyuan.github.io