IRanges用于解決序列在基因組上的位置問題，GRanges在IRanges的基礎(chǔ)上增加了染色體和DNA鏈的信息。在GRanges內(nèi)部可以使用IRanges構(gòu)建序列位置信息...
發(fā)簡信
IP屬地：云南
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GEO數(shù)據(jù)挖掘
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受益匪淺呀
老板親自傳授的文獻(xiàn)閱讀方法
前言 論一個氣場合適的導(dǎo)師的重要性。想起一個微信朋友前截圖 A：導(dǎo)師牛不牛，師兄師姐牛不牛，跟你牛不牛沒有關(guān)系 B：你錯啦，導(dǎo)師牛不牛，師兄師姐牛不牛，很大程度上決定我牛不牛...
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老板親自傳授的文獻(xiàn)閱讀方法前言 論一個氣場合適的導(dǎo)師的重要性。想起一個微信朋友前截圖 A：導(dǎo)師牛不牛，師兄師姐牛不牛，跟你牛不牛沒有關(guān)系 B：你錯啦，導(dǎo)師牛不牛，師兄師姐牛不牛，很大程度上決定我牛不牛...
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學(xué)習(xí)方案：如何才能入門生信？按我前面文章繼續(xù)反思：如何才能入門生信？中提到的學(xué)習(xí)方案執(zhí)行。 總的方案： 孟老師推薦關(guān)于最后一部分的四大切入點，最后是把幾個不同的Seq的過程細(xì)節(jié)都了解一下。 第一部分：l...
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RepeatMasker
What RepeatMasker是一款基于Library-based，通過相似性比對來識別重復(fù)序列，可以屏蔽序列中轉(zhuǎn)座子重復(fù)序列和低復(fù)雜度序列（默認(rèn)將其替換成N），幾乎用于...
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生物技能樹--fasta和fastq格式文件的shell小練習(xí)這個是有機(jī)結(jié)合生物信息學(xué)的linux和數(shù)據(jù)格式的練習(xí)題：下載bowtie2軟件后拿到示例數(shù)據(jù)： http://ascii.911cha.com/ 做題之前的碎碎念：本來用co...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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生信技能樹--Jimmy - Linux 20題一、在任意文件夾下面創(chuàng)建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夾系列。 二、在創(chuàng)建好的文件夾下面，比如我的是 /Users/jimmy/tmp/1/2/3/4/...
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第二部分 第7章基本統(tǒng)計分析
7.1 描述性統(tǒng)計分析 連續(xù)型變量的中心趨勢、變化性和分布形狀的方法。 7.1.1 方法云集 基礎(chǔ)安裝中的函數(shù)：summary()函數(shù)來獲取描述性統(tǒng)計量（最小值、最大值、四分...
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第二部分 第6章 基本圖形
6.1 條形圖 簡單條形圖 barplot() 堆砌條形圖和分組條形圖 均值條形圖 條形圖的微調(diào) par()函數(shù) 棘狀圖 spine()函數(shù) 6.2 餅圖 pie(x, la...
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第五部分第19章使用ggplot2進(jìn)行高級繪圖"學(xué)習(xí)做圖還是以實踐為主，因此寫好腳本的代碼結(jié)合筆記梳理思路。這里筆記比較簡略。" 19.1 R中四種圖形系統(tǒng) 圖形系統(tǒng)的載入 系統(tǒng)基礎(chǔ)安裝中是否包含是否需要顯示加載base...
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第一部分第5章 高級數(shù)據(jù)管理5.1 一個數(shù)據(jù)處理難題 5.2 數(shù)值和字符處理函數(shù) 5.2.1 數(shù)學(xué)函數(shù) 數(shù)學(xué)函數(shù) 函數(shù)描述abs(x)絕對值abs(-4)返回值為4sqrt(x)平方根sqrt(25)返...
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第一部分第4章 基本數(shù)據(jù)管理4.1 一個示例 4.2 創(chuàng)建新變量 變量名 <- 表達(dá)式 運算符描述+加-減*乘/除^ or **求冪x%%y求余x%/%y整數(shù)除法 transform函數(shù)：創(chuàng)建新變量并將...
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第一部分第3章 圖形初階
3.1 使用圖形 載入數(shù)據(jù)plot()函數(shù)abline()函數(shù)加title(" ") 3.2 一個簡單的例子 plot()是R中為對象作圖的一個泛型函數(shù)help(plot)可...
