之前寫的的CHIP-seq和RNA-seq很多練習的數(shù)據(jù)都是從GEO數(shù)據(jù)庫下載的。但是從來沒有細致的了解過GEO這個數(shù)據(jù)庫。趁著還沒復工,再多學一點新知識~這次的筆記是生信技...
筆記回顧:1.GEO數(shù)據(jù)庫視頻學習筆記(芯片數(shù)據(jù)下載和數(shù)據(jù)讀?。?.GEO數(shù)據(jù)庫視頻學習筆記(ID轉(zhuǎn)換)3.GEO數(shù)據(jù)庫視頻學習筆記(了解你的表達矩陣) 這一講的視頻地址是:...
本文首發(fā)于“生信大碗”公眾號,轉(zhuǎn)載請注明出處 今天要給大家分享一個實用的差異分析工具——GEO2R。不需要語言基礎,直接點點點就可以完成。 GEO2R是GEO數(shù)據(jù)庫中的一個在...
一、數(shù)據(jù)下載 官網(wǎng)——搜索并點擊GSE、GLP相應文件下載 文件格式為: txt txt.gz(GSE文件) 二、對txt.gz文件進行解壓縮 使用Rstudio 正常...
GEO2R(GEO to R)是GEO數(shù)據(jù)庫自帶的數(shù)據(jù)分析工具。GEO2R可以通過可視化的方式對基因表達譜進行統(tǒng)計學分析,在操作上非常方便,但是,某些數(shù)據(jù)集不提供GEO2R功...
老大讓復現(xiàn)的是一張韋恩圖,來自3個數(shù)據(jù)集,分別找每個數(shù)據(jù)集的差異基因,然后取UP和DOWN的交集。原文鏈接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/...
基因表達 什么是基因表達,如下是來自于維基百科的解釋: 研究方法 定量PCR 這部分我不太懂,所以就放幾段百度百科和維基百科的定義。 百度百科 定量PCR(即時聚合酶鏈鎖反應...