跟著Cell學(xué)作圖|12.韋恩圖(Vennerable包) “實踐是檢驗真理的唯一標(biāo)準(zhǔn)?！薄皬?fù)現(xiàn)是學(xué)習(xí)生信的最好辦法?！?DOI: 10.1016/j.cell.2020.0...
IP屬地：江蘇
-
跟著Cell學(xué)作圖|12.韋恩圖(Vennerable包) -
clustree ： 聚類可視化利器我們知道在研究問題時，分組是很重要的，有分組才有故事可講。比如，兩塊田一塊施肥一塊不施肥，可以做比較嘛。在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中用到較多的數(shù)據(jù)分組技術(shù)是聚類（clustering）...
-
生信小白教程之Count轉(zhuǎn)TPM，F(xiàn)PKM相信很多科研工作者（不包括比我厲害的大佬們）在做轉(zhuǎn)錄組時，都是在公司做測序，然后數(shù)據(jù)也交給公司分析，又然后，期待做個差異分析，得出像下圖那么完美的熱圖。 然而，然而，，我們得...
-
單細(xì)胞 | 單細(xì)胞數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換：Converting from loom/h5ad to Seurat最近看到Fly Cell Atlas (FCA) 公布果蠅的多個組織的單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)，雖然FCA組織提供了多個在線平臺（例如SCope）進(jìn)行非常方便的可視化和多種分析...
-
單細(xì)胞分析實錄(12): 如何推斷腫瘤細(xì)胞
公眾號后臺回復(fù)20210418，獲取本文的測試數(shù)據(jù) 1. 回顧 前面我已經(jīng)講解了inferCNV的基本用法[http://www.itdecent.cn/p/c01f56b...
-
Django 實現(xiàn)分頁功能當(dāng)頁面因需要展示的數(shù)據(jù)條目過多，導(dǎo)致無法在一個頁面全部顯示。這時，頁面經(jīng)常會采用分頁形式進(jìn)行展示，然后每頁顯示 20 或者 50 等條數(shù)據(jù)。分頁經(jīng)常在網(wǎng)站上隨處可見，它大概是...
-
Django實現(xiàn)分頁和表格搜索功能前言：在百度上查找django分頁功能非常之多，但可用的技術(shù)文檔寥寥無幾。分頁雖說只是我們開發(fā)項目中一個很小的功能，但實現(xiàn)它是十分必要且必須的。因為實現(xiàn)分頁功能，能使我們更加...
-
單細(xì)胞分析實錄(14): 細(xì)胞類型注釋的另一種思路 — CellID
之前寫過一篇細(xì)胞類型注釋的推文：單細(xì)胞分析實錄(7): 差異表達(dá)分析/細(xì)胞類型注釋[http://www.itdecent.cn/p/1887dbd8d9e4]，里面介紹了...
-
整理從TCGA下載的數(shù)據(jù)
如果從TCGA官網(wǎng)網(wǎng)頁下載數(shù)據(jù)，或者使用gdc-client工具下載的數(shù)據(jù)，都是以單個的文件夾形式存儲，并且文件夾中的為壓縮文件，所以，下載數(shù)據(jù)后，第一步就是如何把這些文件復(fù)...
