GSEA簡介 基因集富集分析(GSEA)是一種計算方法,可確定先驗定義的基因集是否在統(tǒng)計上顯示兩種生物學狀態(tài)之間存在顯著一致的差異。來自官網:GSEA[https://www...
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GSEA簡介 基因集富集分析(GSEA)是一種計算方法,可確定先驗定義的基因集是否在統(tǒng)計上顯示兩種生物學狀態(tài)之間存在顯著一致的差異。來自官網:GSEA[https://www...
為何要降維?方便可視化探索;減輕維度詛咒;緩解共線性。降維方法:PCA, t-SNE, UMAP, SOM, LLE 1、主成分分析PCA 主成分分析(Principal C...
'patchwork:合并多個R圖的包' patchwork是基于gglot2的拼圖包,它使得基于ggplot2的圖形更容易拼接在同一個圖層。 安裝 因為作者僅僅在GitHu...
R里面有很多工具包,接收的數據不能直接處理字符串像ggplot2, ggplot(data, aes(x=AAA)),這個的AAA必須是data中的表頭。如果你自己提前定義q...
MECAT2是三代測序數據PacBio的高效組裝工具,是之前MECAT的改進版, 修復了之前的很多bug, 使用基于string graph的fsa替換了之前的mecat2c...
寫在前面 Emmmm,慢慢地發(fā)現越來越多 TBtools 用戶朋友發(fā)表的論文。農學的,醫(yī)學的,大田的,分子的,濕實驗的,數據分析的.... 我可能跟大家有所不同,看到有朋友文...
1. 轉錄組數據統(tǒng)計推斷的難題 在RNA-seq中進行兩組間的差異分析是最正常不過的了。 我們在其它實驗中同樣會遇到類似的分析,通常,我們可以用方差分析判定兩組“分布”數據間...
這個需求真的太常見了!注意問題強調的幾個關鍵詞:一是快速,二是大量,三是差異明顯。在生成大量元素比較圖時要明顯區(qū)分不同樣本,比如宏基因組中的物種分析: 方法一:自定義 自定義...