共病遺傳（或稱異病同根），我們對疾病的認(rèn)識從回溯至遺傳學(xué)根源的那一刻起就已經(jīng)進(jìn)入了另一個新的里程。 今天我想分享一篇今年9月24日發(fā)表于 《Nature communicat...
發(fā)簡信
IP屬地：上海
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共病遺傳的研究方法：關(guān)于多發(fā)性硬化癥和炎癥性腸炎遺傳共病研究的例子 -
@freemandjango 沒反啊
為什么說FPKM和RPKM都錯了？
這本是三年多之前我發(fā)在公眾號上的一篇舊文，一些偶然的機(jī)會，發(fā)現(xiàn)不少朋友也在討論這個問題，因此我重新做了梳理并發(fā)出來。這樣的討論是有益的，放在今天也不過時，我也愿意和更多的朋友...
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ilus: 這是我寫的一個輕量級全基因組（WGS）和全外顯子（WES）最佳實(shí)踐分析流程生成器不知覺間，距離我寫下第一篇關(guān)于 WGS 數(shù)據(jù)分析系列的文章已經(jīng)過去了三年多（WGS 系列文章[https://mp.weixin.qq.com/mp/homepage?__b...
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基于 Cell ID 的單細(xì)胞基因指紋特征提取和細(xì)胞身份識別的新方法我想分享一篇今年四月份發(fā)表在 《Nature biotechnology》 上的文章，題目是 “Gene signature extraction and cell iden...
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堿基周報（第 005 期）：人類壽命的極限記錄每周值得分享的生命科學(xué)和生物信息學(xué)進(jìn)展內(nèi)容，周日發(fā)布。 本周話題：人類壽命的極限 上世紀(jì)60年代，美國加利福尼亞大學(xué)的老年學(xué)專家萊納德·海弗里克用人類表皮細(xì)胞作為實(shí)驗(yàn)對象...
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堿基周報（第 003 期）：人類起源的故事記錄每周值得分享的生命科學(xué)和生物信息學(xué)進(jìn)展內(nèi)容，周日發(fā)布。 封面圖 本周話題：人類起源的故事 從東非大裂谷形成直到演變成東非稀樹草原，地球就進(jìn)入了人類紀(jì)元。從600萬年前開始...
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堿基周報（第 002 期）：申請國家自然科學(xué)基金記錄每周值得分享的生命科學(xué)和生物信息學(xué)進(jìn)展內(nèi)容，周日發(fā)布。 本周話題：申請國家自然科學(xué)基金 這周在國內(nèi)很多科研人員來說，最重要的一個事情就是國家自然科學(xué)基金（簡稱：國自然）的...
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我在簡書上的大量文章都被鎖定了近段時間我在簡書上的文章很多都被平臺鎖定了，應(yīng)該是我在文章后面留了公眾號二維碼的原因。目前沒有申述成功，那么大家如果要看我之前的文章的話，還需移步到我的同名知乎專欄和同名公眾...
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Hands-On Machine Learning with Scikit-Learn and TensorFlow ： Concepts, Tools, and Techniques to Build Intelligent Systems
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基因組學(xué)中的深度學(xué)習(xí)全文6,743字，閱讀30分鐘。 這一篇文章的主題是深度學(xué)習(xí)在基因組學(xué)中的應(yīng)用情況的。文章較長，讀完要花些時間，不過我的建議是通讀第一部分——關(guān)于如何進(jìn)行模型訓(xùn)練的內(nèi)容，讀完...
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為什么不能通過 GATK 的 PL 直接計(jì)算基因型劑量（Genotype dosage）
GATK 的 PL 比較特殊，它是不能直接用于基因型劑量（Genotype dosage）的計(jì)算的。這次我們就來談一談這個問題。 有時候我們需要在項(xiàng)目中用基因型劑量來代替基因...
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@第八天的秘密 ??好多事情啊，我會努力的??
如何使用Shapeit2對人類基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行Phasing
在上一篇文章中，分享了有關(guān)基因組Phasing的原理，一共有三種，分別是：家系關(guān)系分型(Related individuals Phasing)、群體LD分型(LD Phas...
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老板親自傳授的文獻(xiàn)閱讀方法前言 論一個氣場合適的導(dǎo)師的重要性。想起一個微信朋友前截圖 A：導(dǎo)師牛不牛，師兄師姐牛不牛，跟你牛不牛沒有關(guān)系 B：你錯啦，導(dǎo)師牛不牛，師兄師姐牛不牛，很大程度上決定我牛不牛...
