Original 表觀遺傳學(xué)習(xí)小組 Epigenetics表觀遺傳學(xué) 本文根據(jù) 2016 年 8 月復(fù)旦大學(xué)倪挺教授在「表觀基因組學(xué)暑期國際講習(xí)班」中的報(bào)告整理而成，本文采用...
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IP屬地：浙江
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可變剪切——可變剪接及其表觀遺傳調(diào)控
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線粒體相關(guān)研究1. 線粒體的功能概述 1.1 線粒體是真核細(xì)胞的能量代謝中心 2. 線粒體相關(guān)研究方法和思路 2.1 線粒體動(dòng)力學(xué) 2.2 線粒體與細(xì)胞器之間的互作 線粒體與細(xì)胞器互作中研...
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單細(xì)胞免疫組庫：TCR基因重排原理和TCR測序建庫方法單細(xì)胞測序方法和原理系列： 1. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組建庫原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[http://www.itdecent.cn/p/6c5d...
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機(jī)器學(xué)習(xí)在基因組學(xué)中的應(yīng)用1. 機(jī)器學(xué)習(xí)的主要分類 2. 機(jī)器學(xué)習(xí)的主要流程 3 數(shù)據(jù)預(yù)處理 數(shù)據(jù)預(yù)處理指當(dāng)錄入或讀取數(shù)據(jù)后，對數(shù)據(jù)進(jìn)行必要的清理，包括查錯(cuò)糾錯(cuò)、異常觀察值和無效樣本的處理、轉(zhuǎn)換、填補(bǔ)...
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文獻(xiàn)(5): 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組揭示人類纖維化皮膚病中成纖維細(xì)胞的異質(zhì)性一句話評價(jià)：小樣本量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組在冷門疾病領(lǐng)域應(yīng)用前景尚可，常規(guī)套路也能發(fā)NC 1. Title 標(biāo)題可以看出本研究的主要內(nèi)容：①構(gòu)建成纖維細(xì)胞的圖譜/揭示成纖維細(xì)胞的異質(zhì)性...
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10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）CNV分析之inferCNVpy隔離的第七日，孤獨(dú)如影隨形，必須寫一些內(nèi)容來排解心中的無聊，上一篇我們詳細(xì)回顧了copyCAT，文章在10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）CNV分析回顧之CopyKAT[http...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)027--[sc]組織環(huán)境對中性粒細(xì)胞命運(yùn)的共同決定作用最近對中性粒細(xì)胞感興趣，就多讀了幾篇文章。分享的這一篇是20年的cell。 HighlightsNeutrophils have variable lifetimes in ...
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AUCell：計(jì)算單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的每個(gè)細(xì)胞中特定基因集的活性程度AUC允許在單細(xì)胞rna數(shù)據(jù)集中識別具有活性基因集（如gene signature,gene module）的細(xì)胞。AUCell使用曲線下面積來計(jì)算輸入基因集的一個(gè)關(guān)鍵子集是...
