CellPhoneDB作為出鏡率很高的細(xì)胞互作分析工具，也是大家公認(rèn)的。網(wǎng)上有很多教程，按理說在自己單細(xì)胞系列也應(yīng)該出一個教程，但是由于CellPhoneDB是基于pytho...
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一文解決Cellphonedb單細(xì)胞互作分析及可視化作圖（1） -
三大經(jīng)典在線生存分析工具測評導(dǎo)讀 在腫瘤相關(guān)研究中，一張精美的生存分析圖，已經(jīng)成了腫瘤研究高分文章的標(biāo)配。好的臨床預(yù)后效果，往往在一定程度上決定了文章發(fā)表的層次。然而對剛剛拿到一個新基因的新手來說，生存...
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TCGA癌癥類型和樣本代號解析之前分析TCGA數(shù)據(jù)都是直接匹配barcode，其規(guī)則懂的不多。相信有不少同志也有這方面困惑。 這里給出兩份資料，一份是TCGA官方英文介紹，鏈接為https://wiki....
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10X單細(xì)胞空間數(shù)據(jù)分析之表征細(xì)胞狀態(tài)和生態(tài)型（EcoTyper示例代碼）隔離的第四天，一個人的日子總是很難熬，孤獨的生活卻總是來到我的身邊，這一篇我們來分享EcoTyper的示例代碼，幫助我們來尋找細(xì)胞特異性轉(zhuǎn)錄狀態(tài)和共關(guān)聯(lián)模式。這篇發(fā)表于cel...
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10X單細(xì)胞空間數(shù)據(jù)分析之表征細(xì)胞狀態(tài)和生態(tài)型（EcoTyper）隔離的第三天，一個人的日子總是很難熬，沒辦法，孤獨總是常伴我身，今天我們分享的文獻(xiàn)在Atlas of clinically distinct cell states and ...
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第9篇：差異peaks分析——DiffBind學(xué)習(xí)目標(biāo) 學(xué)習(xí)用DiffBind流程評估兩個樣本間的差異結(jié)合區(qū)域 用PCA評估樣本間的關(guān)系 評估不同工具得到的差異peaks的一致性 評估差異peaks富集的工具 ATAC-...
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ChIP-Seq分析
Introduction to ChIP-Seq using high-performance computing https://hbctraining.github.io...
