已有的工具如circos, 只能繪制彎的染色體，又如R包c(diǎn)hromoMap，IdeoViz，karyploteR，ggbio和在線工具Idiographica，雖然能繪制直的...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：重慶
-
RIdeogram：染色體數(shù)據(jù)可視化的R包 -
ggstatsplot-專為學(xué)術(shù)繪圖而生(一)作者:白介素2 美圖神器ggstatsplot-專為學(xué)術(shù)論文而生 在CRAN(comprehensive R Achive Netwokrk)中已有13000多個(gè)R包了簡(jiǎn)單講...
-
WGCNA實(shí)例分析及解讀（附代碼）WGCNA分析基于兩個(gè)假設(shè)：1.相似表達(dá)模式的基因可能存在共調(diào)控、功能相關(guān)或處于同一通路，2.基因網(wǎng)絡(luò)符合無尺度分布?；谶@兩點(diǎn)，可以將基因網(wǎng)絡(luò)根據(jù)表達(dá)相似性劃分為不同的模塊...
-
實(shí)驗(yàn)記錄11：scanpy對(duì)scRNA-seq數(shù)據(jù)的聚類分析R在讀取和處理數(shù)據(jù)的過程中會(huì)將所有的變量和占用都儲(chǔ)存在RAM當(dāng)中，這樣一來，對(duì)于海量的單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù)（尤其是超過250k的細(xì)胞量），即使在服務(wù)器當(dāng)中運(yùn)行，Seura...
-
多組KEGG富集分析結(jié)果怎么展示？先上圖 在做完WGCNA之后，我鎖定了兩個(gè)模塊，但是怎么展示這兩組的KEGG結(jié)果又不會(huì)凌亂呢？我最后想到了如上圖。 做KEGG富集分析 其中colnames(turquois...
-
單細(xì)胞測(cè)序R包PAGODA使用pagoda是2016年在nature methods發(fā)表的一個(gè)分析單細(xì)胞測(cè)序的方法，這個(gè)包并不是很紅火，只是最近在學(xué)習(xí)另一個(gè)基于RNA速率推斷細(xì)胞演化的R包velocyto...
-
08--Correlation Analysis to Validate ResultsPurpose: To validate the cell type enrichment results from the xCell, do correlation an...
-
02-Hi-C輔助基因組安裝基因組組裝 基因組是怎么組裝的，目前的方法有什么局限性？為什么要進(jìn)行基因組組裝？是因?yàn)槟壳暗臏y(cè)序方法，無論是一代、二代、三代都是借助于全基因組鳥槍法（Whole genome...
