AlphaFold2 是由 DeepMind 在 2020 年提出的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測模型，其核心是通過深度學(xué)習(xí)技術(shù)從氨基酸序列預(yù)測蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)，并在 CASP14（Crit...
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AlphaFold2 解讀 -
RF Diffusion
范式再顛覆 | RF Diffusion最強(qiáng)擴(kuò)散式蛋白設(shè)計模型 - 知乎[https://zhuanlan.zhihu.com/p/588535554] RFdiffusio...
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NextFlow用法1--基本概念基本概念 Nextflow是一個反應(yīng)式工作流框架和編程DSL，可以簡化數(shù)據(jù)密集型pipelines的編寫。 它的設(shè)計理念是Linux平臺是數(shù)據(jù)科學(xué)的通用語言。Linux提供了...
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conda create 過程中可能遇到的問題
在conda創(chuàng)建環(huán)境過程中，最常見的問題有幾種1、鏡像源的問題中科大的鏡像好像有問題，需要把鏡像源修改為清華源2、網(wǎng)絡(luò)的問題An HTTP error occurred wh...
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bcl2fastq 產(chǎn)生的多個lane 的fastq.gz 合并
bcl2fastq 產(chǎn)生的文件結(jié)果如下（4個lane fastq.gz 文件）： 現(xiàn)在要將多個lane 的fastq.gz合并，方便下步驟的分析。 方法1： 方法1： 結(jié)果分...
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跟著Nature Genetics學(xué)畫圖：R語言ggbio包畫基因結(jié)構(gòu)圖論文是 Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cultivated and wi...
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用R進(jìn)行microarray分析（1）Introduction 目前主流的表達(dá)譜芯片有兩類：（1）cDNA microarray：將100~5,000bp的cDNA固載到介質(zhì)上 (例如玻璃)，Stanford開發(fā)...
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R語言GOplot畫弦圖展示GO富集分析的結(jié)果之如何準(zhǔn)備自己的數(shù)據(jù)我們首先運(yùn)行幫助文檔里的例子看例子里畫圖用到的數(shù)據(jù)是什么樣子的 查看幫助文檔 運(yùn)行示例數(shù)據(jù)獲得畫弦圖的數(shù)據(jù) 把這個示例數(shù)據(jù)寫出到csv文件里 作圖的數(shù)據(jù)是這樣的，我們模仿這個...
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R語言ggplot2作圖一些好看的顏色搭配這些顏色來自于網(wǎng)頁鏈接 https://www.royfrancis.com/elegant-scientific-graphs-learning-from-examples...
