https://mp.weixin.qq.com/s/bCkZ4L9IJTJTFUWKJMsuFw 來(lái)自聯(lián)川生物 什么是motif? 有特征的短序列,一般認(rèn)為它是擁有生物學(xué)功...
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SingleR包可基于參考數(shù)據(jù)集,實(shí)現(xiàn)對(duì)單細(xì)胞數(shù)據(jù)細(xì)胞類(lèi)型的自動(dòng)注釋。celldex包提供若干常用的人/老鼠的注釋細(xì)胞類(lèi)型的Bulk RNA-seq/microarray參考...
上一篇10x單細(xì)胞分析[http://www.personalbio.cn/Science_ProductIntro.aspx?classid=2&id=107&navcla...
scRNAseq免疫細(xì)胞注釋?zhuān)?免疫細(xì)胞注釋-1:T細(xì)胞[http://www.itdecent.cn/p/0127c9b380c9] 免疫細(xì)胞注釋-2:髓系細(xì)胞[http...
挖掘公共單細(xì)胞數(shù)據(jù)集時(shí),會(huì)遇到常見(jiàn)各種單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)格式?,F(xiàn)總結(jié)如下,方便自己日后調(diào)用,以創(chuàng)建Seurat對(duì)象(1)barcodes.tsv.gz、features.tsv....
原文見(jiàn)Seurat - Guided Clustering Tutorial, Compiled: April 17, 2020 #1 Seurat安裝 #2 數(shù)據(jù)下載 Pe...
一般做純生信數(shù)據(jù)挖掘,基本離不開(kāi)這兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù):TCGA、GEO。按道理,涉及到人或者動(dòng)物的研究都要上傳倫理資料的,但是做純生信數(shù)據(jù)挖掘,病人數(shù)據(jù)都是從數(shù)據(jù)庫(kù)上下載的,沒(méi)有涉及...