發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：云南
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Seurat讀取Visum HD的segmentation結(jié)果
Seurat的beta version支持Space Ranger cell segmentation data的讀取，首先安裝R包seurat...
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記錄運(yùn)行scvelo過(guò)程中的報(bào)錯(cuò)TypeError: Neighbors.compute_neighbors() got an unexpected keyword argum...
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Github 2FA驗(yàn)證最近在登陸github的時(shí)候，總是跳出下面這個(gè)界面： 強(qiáng)制要求2FA驗(yàn)證，否則上不了github。驗(yàn)證方式可以有以下幾種： 比較坑的一點(diǎn)是，gi...
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收集細(xì)胞注釋marker（持續(xù)更新）
"Myeloid": ["PTPRC", "CD68", "CD14", "CSF1R", "CD163", "LYZ"],"T cells":...
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pySCENIC下游可視化（python版本）
Python版SCENIC轉(zhuǎn)錄因子分析（四）一文就夠了-騰訊云開(kāi)發(fā)者社區(qū)-騰訊云 (tencent.com)[https://cloud.ten...
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pySCENIC使用--代碼純享版
我這里的scRNA-seq前期是用scanpy做的，所以首先用scanpy把pySCENIC需要的信息導(dǎo)出來(lái)。 接下來(lái)用pySCENIC進(jìn)行轉(zhuǎn)錄...
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monocle2的使用monocle2和monocle3的基本原理是一樣的，詳見(jiàn)monocle3系列之七：總結(jié) - 簡(jiǎn)書 (jianshu.com)[https://...
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R包的安裝方法都總結(jié)在這兒了！
在線安裝 1）CRAN的包 R的官方包倉(cāng)庫(kù)（Comprehensive R Archive Network, CRAN）提供了大量的開(kāi)源R包，使...
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monocle3系列之七：總結(jié)
monocle3系列之六：共調(diào)控基因模塊 - 簡(jiǎn)書 (jianshu.com)[http://www.itdecent.cn/p/ca5028...