好久沒有更新文章啦~之前寫了幾篇Chip-seq相關的文檔，在果子老師的公眾號中發(fā)布了，近期得空的話應該也會同步到簡書上吧。今天開一個新的文集，想介紹一下大名鼎鼎的Xena網(wǎng)...
發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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我暫時學不會生信，但我想快速查看TCGA數(shù)據(jù)，可以嗎？Xena說，包在我身上！ -
統(tǒng)計多個基因列表交集并畫韋恩圖和Upset圖有時候，我們從GEO數(shù)據(jù)庫挖掘了好幾組數(shù)據(jù)集的差異表達基因，我們需要統(tǒng)計這些基因列表的交集，一般可以用韋恩圖和Upset圖。而韋恩圖一般適合小樣本的交集，而多個樣本的話可以用...
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TCGA-CRC下載數(shù)據(jù) TCGA官網(wǎng)下載TCGA-COAD projiect的HTSeq-counts 和clinical的manifest文件。然后在電腦終端用gdc-client下載數(shù)...
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8.26云發(fā)育論壇報告(頡偉)聽了頡偉老師8.26晚上的一個關于近期工作的匯報，整理如下： minor ZGA & major ZGA minor ZGA的特點：雖然只是少量Gene開啟轉錄，但轉錄量可以...
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比較Endnote和CitaviOverview 我一開始用Endnote管理軟件，后來覺得Endnote檢索文件的功能體驗太差，換了Citavi，可能大家都很熟悉Endnote不熟悉Citavi，這里簡單...
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停更
本想注銷賬號，后來隨便翻了翻，還是沒舍得。簡書曾讓我投入了很多感情，碼文章也占用了我很多時間，就像自己養(yǎng)大的花一樣，不是隨便就能掐死的。停更大概一年了，主要原因是認識到自己有...
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書籍排版軟件 R bookdown 安裝簡介 R bookdown 可以看作使用 Markdown 進行排版的 Latex 軟件。你用 Markdown 來寫文章或書籍，它用 Latex 渲染出來，輸出排版優(yōu)美的 ...
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TCGA學習02：差異分析TCGA學習01：數(shù)據(jù)下載與整理 - 簡書 TCGA學習02：差異分析 - 簡書 TCGA學習03：生存分析 - 簡書 TCGA學習04：建模預測-cox回歸 - 簡書...
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「r<-workshop」第一期：我理解的（生信）數(shù)據(jù)分析核心基礎我在簡書和公眾號上已經(jīng)分享了很多之前學習的數(shù)據(jù)分析筆記和文章，覆蓋了各方面的內(nèi)容，數(shù)據(jù)分析方面以后不會再個人分享特別基礎的東西了。接下來我會讓師弟師妹們定期分享自己的學習過程...
