好久沒有更新文章啦~之前寫了幾篇Chip-seq相關的文檔,在果子老師的公眾號中發(fā)布了,近期得空的話應該也會同步到簡書上吧。今天開一個新的文集,想介紹一下大名鼎鼎的Xena網(wǎng)...
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有時候,我們從GEO數(shù)據(jù)庫挖掘了好幾組數(shù)據(jù)集的差異表達基因,我們需要統(tǒng)計這些基因列表的交集,一般可以用韋恩圖和Upset圖。而韋恩圖一般適合小樣本的交集,而多個樣本的話可以用...
下載數(shù)據(jù) TCGA官網(wǎng)下載TCGA-COAD projiect的HTSeq-counts 和clinical的manifest文件。然后在電腦終端用gdc-client下載數(shù)...
聽了頡偉老師8.26晚上的一個關于近期工作的匯報,整理如下: minor ZGA & major ZGA minor ZGA的特點:雖然只是少量Gene開啟轉錄,但轉錄量可以...
Overview 我一開始用Endnote管理軟件,后來覺得Endnote檢索文件的功能體驗太差,換了Citavi,可能大家都很熟悉Endnote不熟悉Citavi,這里簡單...
本想注銷賬號,后來隨便翻了翻,還是沒舍得。簡書曾讓我投入了很多感情,碼文章也占用了我很多時間,就像自己養(yǎng)大的花一樣,不是隨便就能掐死的。停更大概一年了,主要原因是認識到自己有...
簡介 R bookdown 可以看作使用 Markdown 進行排版的 Latex 軟件。你用 Markdown 來寫文章或書籍,它用 Latex 渲染出來,輸出排版優(yōu)美的 ...
TCGA學習01:數(shù)據(jù)下載與整理 - 簡書 TCGA學習02:差異分析 - 簡書 TCGA學習03:生存分析 - 簡書 TCGA學習04:建模預測-cox回歸 - 簡書...
我在簡書和公眾號上已經(jīng)分享了很多之前學習的數(shù)據(jù)分析筆記和文章,覆蓋了各方面的內(nèi)容,數(shù)據(jù)分析方面以后不會再個人分享特別基礎的東西了。接下來我會讓師弟師妹們定期分享自己的學習過程...