關(guān)于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組轉(zhuǎn)錄因子的分析我們之前在單細(xì)胞系列講過(guò)R語(yǔ)言版本的，參考：跟著Cell學(xué)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析(十二):轉(zhuǎn)錄組因子分析[http://mp.weixin.qq.co...
IP屬地：北京
-
PySCENIC（一）：python版單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組轉(zhuǎn)錄因子分析
-
R語(yǔ)言|Cox模型校準(zhǔn)度曲線(xiàn)繪制轉(zhuǎn)自個(gè)人微信公粽號(hào)【易學(xué)統(tǒng)計(jì)】的統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)筆記：R語(yǔ)言實(shí)現(xiàn)Cox模型校準(zhǔn)度曲線(xiàn)繪制[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU4MjgyODQzN...
-
單細(xì)胞交響樂(lè)17-不同單細(xì)胞R包的數(shù)據(jù)格式相互轉(zhuǎn)換劉小澤寫(xiě)于2020.7.18為何取名叫“交響樂(lè)”？因?yàn)閱渭?xì)胞分析就像一個(gè)大樂(lè)團(tuán)，需要各個(gè)流程的協(xié)同配合單細(xì)胞交響樂(lè)1-常用的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)SingleCellExperiment單...
-
單細(xì)胞之富集分析-2：批量GSEA和GSVA分析單細(xì)胞富集分析系列： 單細(xì)胞之富集分析-1：?jiǎn)渭?xì)胞GSEA分析流程[http://www.itdecent.cn/p/00f069cb239c] 1. 背景 Gene Se...
-
67-R中dataframe與list的轉(zhuǎn)換
內(nèi)容概覽 1、dataframe轉(zhuǎn)換為list-- 1.1. 每一列作為list的一個(gè)元素-- 1.2. 每一行作為list的一個(gè)元素-- 1.3. 對(duì)行進(jìn)行分組，每一組作為...
-
安裝ComplexHeatmap報(bào)錯(cuò)，cairo安裝問(wèn)題ComplexHeatmap安裝了之后，加載一直報(bào)錯(cuò)，報(bào)錯(cuò)信息如下： 看樣子是Cairo 沒(méi)有加載上嘗試安裝加載 安裝正常，還是加載報(bào)錯(cuò) 首先百度各種消息唯一可能有效的是簡(jiǎn)書(shū)...
-
纖維化機(jī)制：Myofibroblast的來(lái)源和功能1. 簡(jiǎn)介 纖維化是由肌成纖維細(xì)胞在慢性炎癥反應(yīng)中過(guò)度沉積細(xì)胞外基質(zhì)（ECM）蛋白引起的疤痕和組織硬化。多種有害刺激（包括毒素、傳染性病原體、自身免疫反應(yīng)和機(jī)械應(yīng)激）能夠誘導(dǎo)...
-
TCGA文章復(fù)現(xiàn)——LncRNA-CRC預(yù)后Title:An Integrated Three-Long Non-coding RNA Signature Predicts Prognosis in Colorecta...
-
TCGA數(shù)據(jù)的一致性聚類(lèi)實(shí)戰(zhàn)和可視化通過(guò)不同的聚類(lèi)算法，依據(jù)不同的基因或指標(biāo)給樣本聚類(lèi)，是數(shù)據(jù)挖掘文章里面經(jīng)常出現(xiàn)的操作咯。接下來(lái)要寫(xiě)寫(xiě)不同聚類(lèi)方法的介紹和代碼實(shí)現(xiàn)啦。 1.輸入數(shù)據(jù) 目前從網(wǎng)上找到的代碼大多是...
