青春有你出席不是為了讓你缺席 好想沿著回憶狂奔向你 昨日的青空 隨少年揮手消失在人海之中 ——尤長靖《昨日青空》 前幾天，因為軍爺就要結(jié)婚了跟狗佳聊天，感嘆了時光飛逝之后就開...
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R繪制G矩陣聚類圖（環(huán)形、橫向、縱向）
環(huán)境：R 4.2.2，Rstudio 2022.07.2，win111、gcta計算G矩陣gcta64 --bfile 20221115-393id --make-grm -...
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LD單倍型塊圖的繪制大家好，今天給大家分享一個軟件(LDBlockShow)用來繪制LD單倍型塊圖。在文獻(xiàn)中我們經(jīng)?？吹絻深悎D會用到連鎖不平衡，一類是LD衰減圖，另一類就是LD單倍型塊圖。需要畫...
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RNA-seq(7): DEseq2篩選差異表達(dá)基因并注釋(bioMart)============================================寫在前面：可以參考另外一篇《得到差異基因后怎么做？[https://www.jians...
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vcf文件與vcftools（二）
vcftools是用來處理vcf和bcf文件的工具集，功能涵蓋了過濾，數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換，一些指標(biāo)的統(tǒng)計計算，vcf文件之間變異信息的差異比較等等。 1.基本用法 2.使用 官網(wǎng)提...
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RNA-seq完整分析過程linux基本命令 第六章 Linux文件與目錄管理 極客學(xué)院服務(wù)器 高通量相關(guān)基礎(chǔ)知識 生信一百講 1、 Anaconda Anaconda是一個Python下和Canop...
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重測序數(shù)據(jù)（簡化基因組和非簡化基因組）的Clean data 到snp-indel的vcf步驟
最近有多個朋友問我關(guān)于二代重測序數(shù)據(jù)的分析問題（clean data 到vcf），我寫了一個完整的步驟如下，若你是多個樣品進(jìn)行分析，最好是寫 循環(huán)語句，這里我僅舉一個例子“s...
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NGS 數(shù)據(jù)過濾之 Trimmomatic 詳細(xì)說明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始數(shù)據(jù)過濾對后續(xù)分析至關(guān)重要，去除一些無用的序列也可以提高后續(xù)分析的準(zhǔn)確率和效率。Trimmomatic 是...
