開始操作 第一步：準(zhǔn)備原始測(cè)序數(shù)據(jù) 我們下載第一個(gè)：GSE106273_RAW.tar（183.5 Mb）[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：四川
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使用merge整合多組單細(xì)胞數(shù)據(jù) -
單細(xì)胞之富集分析-1：?jiǎn)渭?xì)胞GSEA分析流程單細(xì)胞GSEA分析需要的文件有兩個(gè)：1. 單細(xì)胞基因表達(dá)變化數(shù)據(jù)（兩列，一列是geneid/gene symbol，一列是logFC）（文件格式：.rnk）2. 目標(biāo)基因集（...
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使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第十四章)本文首發(fā)于我的個(gè)人博客， http://xuzhougeng.top/ 往期回顧: 使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第一章) 使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-...
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使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第十二章)本文首發(fā)于我的個(gè)人博客， http://xuzhougeng.top/ 往期回顧: 使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第一章) 使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-...
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使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第十章)本文首發(fā)于我的個(gè)人博客， http://xuzhougeng.top/ 往期回顧: 使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第一章) 使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-...
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單/多個(gè)基因在組間同時(shí)展示的多種選擇：分組小提琴圖、分組/分面柱狀圖、單基因蜂群點(diǎn)圖拼圖繪制這是ggplot2可視化專題的第二個(gè)實(shí)例操作 【ggplot2的基本思路見前文總論】：基于ggplot2的RNA-seq轉(zhuǎn)錄組可視化：總述和分文目錄 【ggplot2繪圖具體...
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單細(xì)胞CNV分析——inferCNV 結(jié)果再挖計(jì)算每個(gè)細(xì)胞的CNV score或者判斷每個(gè)細(xì)胞是否是癌細(xì)胞 文獻(xiàn)《Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heteroge...
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基于單細(xì)胞測(cè)序的蛋白活性推斷（PISCES）分析流程筆記，凎！
寫在前面 感謝califano-lab[https://github.com/califano-lab]團(tuán)隊(duì)將代碼無私的分享出來=。=！ 本流程需要一點(diǎn)點(diǎn)R語言與linux基...
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相關(guān)性分析 | R語言 -- 相關(guān)性矩陣及可視化感謝各位簡(jiǎn)友一直的關(guān)注。 請(qǐng)關(guān)注：感謝陪伴[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg4MjY2NTA2Nw==&mid=2247483891&...
