前面給大家介紹了，自己不會(huì)寫(xiě)R函數(shù)如何去“抄”高手寫(xiě)好的函數(shù)[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com...
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R函數(shù)，如何“抄”出水平 -
STEP4: 得到表達(dá)矩陣的流程SRA—>FASTQ—>BAM—>COUNTS 這幾個(gè)步驟而已，中間穿插一些質(zhì)控的手段，每個(gè)步驟選擇好合適的軟件即可。可以參考：一個(gè)植物轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目的實(shí)戰(zhàn) http://www...
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RNA-seq從入門(mén)到自閉（數(shù)據(jù)下載）使用TBtools，大家可以輕松從NCBI和ENA獲得文件的下載地址。接下來(lái)就是下載SRA文件。 sra文件的下載方式有很多種，你可以用迅雷離線拖，百度離線下載，也可以用選擇...
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fastqc 批處理文件當(dāng)我們獲取到許多的測(cè)序數(shù)據(jù)的fastq文件，我們?yōu)榱朔奖悖ㄟ^(guò)shell編程寫(xiě)一個(gè)批處理腳本來(lái)對(duì)許多文件進(jìn)行質(zhì)控。1 首先在創(chuàng)建一個(gè)文件夾存放fastq文件或者fastq....
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RNA-seq轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析B站：RNA-seq轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析入門(mén)實(shí)戰(zhàn) 1 linux常用命令 .bashrc中可以添加一些常用快捷方式，也可以將軟件添加到環(huán)境變量如何用vi編輯和保存文件[https:...
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R 問(wèn)題解決 | 錯(cuò)誤: With R version 3.5 or greater, install Bioconductor packages using BiocManager; see...
在使用如下代碼安裝Bioconductor來(lái)源的package時(shí)， 遇到如下報(bào)錯(cuò)： 錯(cuò)誤: With R version 3.5 or greater, install Bi...
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高通量測(cè)序數(shù)據(jù)處理學(xué)習(xí)記錄（零）：NGS分析如何選擇合適的參考基因組和注釋文件前言 現(xiàn)有比對(duì)工具在做mapping之前，都需要下載對(duì)應(yīng)物種的參考基因組做index，而如何選擇合適的參考基因組是一件非常重要的事情。 現(xiàn)有的參考基因組存儲(chǔ)網(wǎng)站三個(gè)：ENSE...
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RNAseq002 轉(zhuǎn)錄組入門(mén)(2) ：數(shù)據(jù)下載1 獲取文章數(shù)據(jù) 1.1 獲得文章數(shù)據(jù)地址 AKAP95 regulates splicing through scaffolding RNAs and RNA proces...
