利用python的xml包，對kegg的xml數(shù)據(jù)進(jìn)行提取。根據(jù)這些數(shù)據(jù)，可以實(shí)現(xiàn)代謝路徑的數(shù)據(jù)整合、重構(gòu)或解析。 在這里沒有對ElementTree的用法進(jìn)行系統(tǒng)的解析。具...
發(fā)簡信
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利用python提取kegg的xml文件信息
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基于代謝物和代謝物反應(yīng)的Gephi網(wǎng)絡(luò)分析過程1.excel中代謝物簡化 【注意】以下過程為vba編程 1.1 excel格式模板 1.2 vba代碼 替換結(jié)束后，手動將反應(yīng)簡寫列和反應(yīng)式列粘貼至Sheet3 2. 化合...
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Perl語言極簡多線程的實(shí)現(xiàn)
Threads不用說肯定是最經(jīng)典的多線程管理，但是如果你有以下需求： 我就想設(shè)置一個(gè)數(shù)，比如8，之后我大循環(huán)每次開始8個(gè)線程同時(shí)工作，哪個(gè)跑完了再補(bǔ)一個(gè)，保持有最大8個(gè)線程工...
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Ubuntu修改CPAN源
網(wǎng)上的教程基本都在說usr里面改config.pm，然鵝應(yīng)該是perl改版了，所以路徑下并沒有。 Ubuntu平臺的位置在：~/.cpan/CPAN/MyConfig.pm把...
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Ubuntu16.04極簡配置Tensorflow GPU環(huán)境折騰了一周多，終于發(fā)現(xiàn)了一個(gè)炒雞簡單的方法＝-＝，最后一行命令裝好全部環(huán)境。 環(huán)境的Ubuntu16.04，Windows的話差不多，總的來說就是用cuda裝超級容易。 ?先...
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Ubuntu安裝Tensorflow-GPU報(bào)錯(cuò)處理
先說幾個(gè)坑： 1. 從Nvidia官網(wǎng)下周CUDA一定看準(zhǔn)版本，10.0千萬別下成10.1這種 2. 安裝好cuDNN幾個(gè)配置環(huán)境 export LD_LIBRARY_PAT...
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普通博士如何找海外博士后
又是一年畢業(yè)季，新畢業(yè)的博士開始準(zhǔn)備找博后。本文根據(jù)自己的教訓(xùn)整理了一些如何做找生物（生物信息學(xué)）博士后的經(jīng)驗(yàn)。 首先要明確的是，博后只是一個(gè)過渡階段，是對將來準(zhǔn)備在研究道路...
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基因結(jié)構(gòu)圖-分分鐘學(xué)會小編今天給大家介紹一款在線繪制基因結(jié)構(gòu)的工具Gene Structure Dispaly Server，簡單好用功能還挺強(qiáng)大。運(yùn)用它能夠繪制清晰的基因結(jié)構(gòu)，清晰明了地展示外顯...
