您好,請教一下,公司技術(shù)告訴我,他們處理全長轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),只是將完全一致的序列去掉了,相同的但是長短不一的序列會被留下。那我應(yīng)該怎么處理數(shù)據(jù),能去掉這些重復(fù)的序列呢
iso-seq全長轉(zhuǎn)錄本這個是我在聽報告時聽到的,對這個比較感興趣,這里作為學(xué)習(xí)筆記 關(guān)于iso-seq 首先介紹下iso-seq,這是基于PacBio的單分子實時測序,隸屬于三代測序,其特點是超長...
您好,請教一下,公司技術(shù)告訴我,他們處理全長轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),只是將完全一致的序列去掉了,相同的但是長短不一的序列會被留下。那我應(yīng)該怎么處理數(shù)據(jù),能去掉這些重復(fù)的序列呢
iso-seq全長轉(zhuǎn)錄本這個是我在聽報告時聽到的,對這個比較感興趣,這里作為學(xué)習(xí)筆記 關(guān)于iso-seq 首先介紹下iso-seq,這是基于PacBio的單分子實時測序,隸屬于三代測序,其特點是超長...
作者:Arno審稿:童蒙編輯:angelica 全長轉(zhuǎn)錄組測序(Isoform-sequencing,Iso-seq)基于PacBio單分子實時測序技術(shù)(SMRT cell)...
我也是一樣的問題,請問您解決了嗎
基因家族專題(3):基因家族成員的鑒定Data preparation 繼續(xù)上次的內(nèi)容,下載好數(shù)據(jù)后就可以正式開始鑒定了。首先回顧一下,下載好的數(shù)據(jù)。 基因組序列信息,存儲基因組序列信息的.fasta文件。還有其...
最經(jīng)典和廣為熟知的多序列比對軟件是 clustalw 。 但是現(xiàn)有的多序列比對軟件較多,有文獻(xiàn)報道:比對速度(Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffee),...
您好最后一步需要根據(jù)identity大于百分之多少進(jìn)行進(jìn)一步篩選嗎
生信小白必備工具:BLAST這期開始將會系統(tǒng)的介紹一些生信初學(xué)者經(jīng)常使用的工具,流程,敬請大家關(guān)注。首先今天和大家講講本地版的BLAST,一款作為生信工作者的你,這個是你每天都會用到的工具。這個網(wǎng)頁版的...
你好,我想問下沒有參考基因組,測了二代和三代數(shù)據(jù),分析流程是否與基因組的不一樣呢,那么應(yīng)該如何分析呢
轉(zhuǎn)錄組分析入門 2 —— 基本流程?? 注:此文基本全部按照 簡書 劉小澤:轉(zhuǎn)錄組那些事兒 Part II 進(jìn)行,感謝??,以下代碼親測有效,如有問題歡迎隨時與我溝通。 準(zhǔn)備工作?? 1. 登錄服務(wù)器(本小白...