看過(guò)很多GEO數(shù)據(jù)挖掘的教程，一直都是芯片數(shù)據(jù)舉例。我自己也根據(jù)流程（Taolu）分析過(guò)好幾個(gè)geo芯片數(shù)據(jù)。一直有個(gè)疑惑， GEO上都是芯片數(shù)據(jù)嗎？ GSE開頭的都是芯片數(shù)...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：海南
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GEO上都是芯片數(shù)據(jù)嗎？GSE開頭的都是芯片嗎 -
數(shù)據(jù)分析：基于GSVA的通路富集分析與傳統(tǒng)的Over Representation Analysis: the up- or down-regulated DEGs和Gene Set Enrichment An...
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表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)（eQTL）的概念及其相關(guān)分析
表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)（expression quantitative trait locus, eQTL）是一類能夠影響基因表達(dá)量的遺傳位點(diǎn)（大部分都是單核苷酸多態(tài)性，SNP），...
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生信筆記5-GWAS與eQTL引言 GWAS與eQTL都是用于研究基因位點(diǎn)與表型之間關(guān)系的手段，彼此之間存在很多的區(qū)別與聯(lián)系。 GWAS 全基因組關(guān)聯(lián)分析（Genome Wide Association ...
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網(wǎng)頁(yè)在線做富集分析用clusterProfiler做其實(shí)夠用了，網(wǎng)頁(yè)在線做沒(méi)多大必要，能夠起起對(duì)照作用吧。網(wǎng)頁(yè)在線做，后續(xù)挑出自己想要的模塊，會(huì)方便一些，但自己用包做手動(dòng)挑也還好。記錄這篇，...
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041 | 生信SCI-生信分析后，實(shí)驗(yàn)該如何驗(yàn)證？
常規(guī)3個(gè)驗(yàn)證思路： 1）高通量的生信數(shù)據(jù)挖掘的結(jié)果，用低通量的實(shí)驗(yàn)技術(shù)去驗(yàn)證，也就是我們常規(guī)說(shuō)的，qCPR,WB/IHC簡(jiǎn)單驗(yàn)證下篩選出hub gene或者單基因的表達(dá)水平（...
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STRING數(shù)據(jù)庫(kù)的蛋白質(zhì)相互作用（PPI）網(wǎng)絡(luò)分析在轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)的文獻(xiàn)中，我們經(jīng)常能夠看到這樣的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)（protein protein interaction network，PPI network）。具體而言，...
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WGCNA分析教程五 | [更新版]一邊學(xué)習(xí)，一邊總結(jié)，一邊分享！ 往期WGCNA分析教程 WGCNA分析 | 全流程分析代碼 | 代碼一[https://mp.weixin.qq.com/s/M0LAlE-6...
