scRNAseq免疫細(xì)胞注釋： 免疫細(xì)胞注釋-1：T細(xì)胞[http://www.itdecent.cn/p/0127c9b380c9] 免疫細(xì)胞注釋-2：髓系細(xì)胞[http...
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免疫細(xì)胞注釋-1：T細(xì)胞 -
多個(gè)10x單細(xì)胞對象的合并和批次校正--seurat錨點(diǎn)整合+Harmony練習(xí)數(shù)據(jù)集的GEO編號：GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
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【空間&單細(xì)胞組學(xué)】第1期：單細(xì)胞結(jié)合空間轉(zhuǎn)錄組研究PDAC腫瘤微環(huán)境6.19那天我在公粽號發(fā)布了創(chuàng)建空間&單細(xì)胞組學(xué)文獻(xiàn)學(xué)習(xí)小組的帖子，同時(shí)出了幾個(gè)思考題。因?yàn)槿藬?shù)有所控制，最終的小組成員只確定了9位，還有十多位聯(lián)系我的朋友，沒有趕上這次的班...
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單細(xì)胞多樣本整合-GSE162631GSE162631，4個(gè)膠質(zhì)瘤樣本，總計(jì)5萬多個(gè)細(xì)胞。Seurat+CCA整合+singleR跑了跑。
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Read count CPM RPKM FPKM tpm
RNA-seq看表達(dá)量高低是看哪個(gè)值？1.Read count(1)數(shù)值概念：比對到gene A的reads數(shù)。(2)用途：用于換算CPM、RPKM等后續(xù)其他指標(biāo)；作為基因表...
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轉(zhuǎn)錄組測序和全轉(zhuǎn)錄組測序的區(qū)別1. 全轉(zhuǎn)錄組測序 全轉(zhuǎn)錄組廣義上是指細(xì)胞在特定狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA。借助高通量測序技術(shù)，可以全面獲取樣本中轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物信息，結(jié)合競爭...
