============================================寫在前面:可以參考另外一篇《得到差異基因后怎么做?[https://www.jians...
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本文應(yīng)該是第二全的WGCNA分析教程,參考了最新的文檔。第一全的還在路上,會出現(xiàn)于生信寶典和宏基因組公眾號組織的二代三代轉(zhuǎn)錄組測序分析實戰(zhàn)班上,歡迎點擊鏈接了解更多。 WGC...
Hadley Wickham創(chuàng)建的可視化包ggplot2可以流暢地進(jìn)行優(yōu)美的可視化,但是如果要通過ggplot2定制一套圖形,尤其是適用于雜志期刊等出版物的圖形,對于那些沒有...
前言 GDCRNATools 是一個用于下載、整理和綜合分析GDC中IncRNA、mRNA和miRNA數(shù)據(jù)的R/Bioconductor包。主要功能包括:差異基因分析、生存分...
Principal component analysis (PCA) 是一個統(tǒng)計學(xué)方法,用一組較少的不相關(guān)的變量代替大量相關(guān)變量,同時盡可能保留初始變量的信息,這些推導(dǎo)所得的...
一文看懂PCA主成分分析中介紹了PCA分析的原理和分析的意義(基本簡介如下,更多見博客),今天就用數(shù)據(jù)來實際操練一下。 在生信寶典公眾號后臺回復(fù)“PCA實戰(zhàn)”,獲取測試數(shù)據(jù)。...
對于集合的可視化,第一時間想到的都是韋恩圖(venn diagram),一般集合不超過5個的時候,可視化效果還是不錯的 但是一旦數(shù)據(jù)集增加,比如說五個的時候,你就很難從圖中解...
這一次,我們來聊聊基因組注釋。首先問自己一個問題,為什么要進(jìn)行基因注釋。就我目前而言,它用來解決如下問題: 在mapping-by-sequencing的時候,我找到了一些可...