論文 Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specif...
發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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跟著Nature Metabolism學(xué)作圖:R語言ggplot2水平堆積柱形圖并添加同組連線 -
這個(gè)世界流行離開，但我們卻不擅長告別
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利用R語言將新版TCGA突變數(shù)據(jù)整理成0-1矩陣
1. 下載所需樣本的maf文件 網(wǎng)址：https://portal.gdc.cancer.gov/[https://portal.gdc.cancer.gov/]simple...
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為什么filter_SAM_body過濾出來為0呢
根據(jù)barcode過濾bam文件
10x 單細(xì)胞產(chǎn)生的BAM文件可以根據(jù)所需的barcode進(jìn)行過濾。首先，將所需的cell barcode條形碼放入 filter.txt中。并在barcode前面加上CB:...
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報(bào)錯(cuò): createArrowFiles has encountered an error, checking if any ArrowFiles completed. 請問如何解決呢
ArchR官網(wǎng)教程學(xué)習(xí)筆記1：Getting Started with ArchR
前面的學(xué)習(xí)筆記里，對于scATAC-seq的分析，使用的是signac R包進(jìn)行的。前幾天在一次偶然的機(jī)會(huì)里，有幸和一個(gè)專門做生信的老外聊了聊（紐約某校的PI），從他那里聽說...
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北京基因組所研究生<br><br>Focus on Bioinformatics and Machine-Learning<br><br>Follow me on Github: <a href="https://github.com/Ming-Lian" rel="nofollow" target="_blank">https://github.com/Ming-Lian</a><br><br>跳出局部最優(yōu)，搜索全局最優(yōu)
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CRISPR指數(shù): 可有效預(yù)測低級(jí)別膠質(zhì)瘤病人的預(yù)后今天跟大家分享一篇2022年4月發(fā)表在Frontiers in Genetics (2020 IF=4.6)上的一篇文章，題目為“A novel CRISPR/Cas9 sc...
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時(shí)間復(fù)雜度與空間復(fù)雜度的計(jì)算算法（Algorithm）是指用來操作數(shù)據(jù)、解決程序問題的一組方法。算法是大廠、外企面試的必備項(xiàng)，也是每個(gè)高級(jí)程序員的必備技能。針對同一問題，可以有很多種算法來解決，但不同的...
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是的，所有的回歸都需要考慮共線性
臨床生信文章普遍存在的兩個(gè)統(tǒng)計(jì)問題
臨床預(yù)后模型，大多包含風(fēng)險(xiǎn)分層和獨(dú)立預(yù)后分析兩個(gè)驗(yàn)證分析，而很多文章在兩個(gè)分析上存在不嚴(yán)謹(jǐn)。下面介紹一些分析的關(guān)鍵點(diǎn)。 1. 風(fēng)險(xiǎn)分層與cutoff 一般而言，預(yù)后模型會(huì)有訓(xùn)...
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臨床生信文章普遍存在的兩個(gè)統(tǒng)計(jì)問題
臨床預(yù)后模型，大多包含風(fēng)險(xiǎn)分層和獨(dú)立預(yù)后分析兩個(gè)驗(yàn)證分析，而很多文章在兩個(gè)分析上存在不嚴(yán)謹(jǐn)。下面介紹一些分析的關(guān)鍵點(diǎn)。 1. 風(fēng)險(xiǎn)分層與cutoff 一般而言，預(yù)后模型會(huì)有訓(xùn)...
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不是前輩，互相學(xué)習(xí)??
clusterProfiler導(dǎo)入失敗解決辦法
最近在安裝光叔的clusterProfiler包時(shí)，遇到了以下報(bào)錯(cuò)： 即可以正常安裝，但不能導(dǎo)入。 顯示錯(cuò)誤：package or namespace load faile...
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糖基化+卵巢癌碰撞出怎樣的火花？今天給大家介紹一篇2022年3月發(fā)表在Oxidative Medicine and Cellular Longevity（IF=6.5）上的文章：Glycosylation-...
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2022年發(fā)表的一篇6+單基因泛癌研究分享一篇2022年3月發(fā)表在《Oxidative Medicine and Cellular Longevity》上的研究文章。 題目：The Prognostic Valu...
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clusterProfiler導(dǎo)入失敗解決辦法最近在安裝光叔的clusterProfiler包時(shí)，遇到了以下報(bào)錯(cuò)： 即可以正常安裝，但不能導(dǎo)入。 顯示錯(cuò)誤：package or namespace load faile...
