最近剛返校，事情比較多，每天也很忙，之前寫的《基因家族擴(kuò)張與收縮分析及物種進(jìn)化樹構(gòu)建（上）》也一直沒來得及更新，缺少cafe輸出結(jié)果的解讀及后面的可視化。最近在簡(jiǎn)書上也收到了...
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基因家族擴(kuò)張與收縮分析及物種進(jìn)化樹構(gòu)建（下） -
基因家族擴(kuò)張與收縮分析及物種進(jìn)化樹構(gòu)建（上）一、數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 首先，選取不同物種的Protein數(shù)據(jù)集：Arabidopsis_thaliana.fa；Citrus_grandis.fa；Dimocarpus_longan...
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計(jì)算分子進(jìn)化-搞懂PAML的正選擇分析許多基因組的文章里都會(huì)提到使用PAML進(jìn)行基因的正選擇分析(positive selection), 網(wǎng)上也有一些教程介紹如何用PAML進(jìn)行分析。無論是文章，還是教程，大多只...
