刷了機,安裝好conda環(huán)境后conda又瘋了。conda install -y samtools hisat2 bowtie2 bwa htseq bowtie報錯開始 ...
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雖然是做生物信息的,但是經(jīng)常被一些基礎(chǔ)性概念所困擾……而我又是一個強迫癥,于是把這些亂七八糟的東西整理了一下,強行寫了一篇小文章。東西太雜,但是彼此相關(guān),實在想不到什么合適的...
今天介紹如下三點內(nèi)容: PCA是如何計算的 如何計算每個PC所能解釋的方差 特征值與PC解釋方差比例的關(guān)系 1. 使用R語言自帶函數(shù)prcomp計算PCA 并計算每個PC所能...
忽略矩形中的蛋白顏色,但不要忽略箭頭的顏色 均手工繪制,通過查閱文獻還有KEGG綜合所畫,錯誤在所難免??闪粞浴⒖嘉墨I眾多,不再一一列出。 ----------------...
2018年8月份的時候,我也使用過seurat來分析單細胞測序數(shù)據(jù),然后最近也需要使用seurat包來分析實驗室的單細胞測序數(shù)據(jù),在R中安裝完seurat的包后,我到網(wǎng)站上下...
相關(guān)性分析用于評估兩個或多個變量之間的關(guān)聯(lián)性。 1. 兩個變量的相關(guān)性分析 參數(shù)相關(guān)性檢驗( parametric correlation ) 皮爾森相關(guān)性分析是一種參數(shù)相關(guān)...
把RNA-seq(2)-2下載的sra文件轉(zhuǎn)換為fastq格式的測序文件,并且用fastqc軟件測試測序文件的質(zhì)量,理解各指標的意義。 1 數(shù)據(jù)解壓:用samtools中的f...
簡介 Markdown 是一種輕量級標記語言,它用簡潔的語法代替排版,使我們專心于碼字。它的目標是實現(xiàn)易讀易寫,成為一種適用于網(wǎng)絡(luò)的書寫語言。同時,Markdown支持嵌入h...