為什么有些人總是能發(fā)好幾篇純生信SCI？因?yàn)槿思艺莆樟朔椒ǎ缋猛环軬EO數(shù)據(jù)可以發(fā)兩篇SCI，具體操作如下： 第一篇純生信SCI可以這樣做： 第一步，數(shù)據(jù)下載處理、合...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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純生信發(fā)文的新技能，同一份GEO數(shù)據(jù)可以發(fā)兩篇SCI
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GEO數(shù)據(jù)庫(kù)下載及提取gene①下載TXT文件和平臺(tái)文件 若數(shù)據(jù)平臺(tái)文件無(wú)gene symbol 和探針序列or GBlist，則無(wú)法注釋。 ②ID轉(zhuǎn)換 1.平臺(tái)文件有g(shù)ene symbol 平臺(tái)文件改名...
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WGCNA文檔使用教程本文是對(duì)WGCNA英文說明文檔的翻譯，英文的請(qǐng)查看這里[https://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork/...
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65.《Bioinformatics Data Skills》之使用samtools提取與過濾比對(duì)結(jié)果
上節(jié)我們已經(jīng)知道samtools view命令可以用于轉(zhuǎn)換sam與bam文件類型，其實(shí)samtools view還可以用于提取與過濾比對(duì)結(jié)果，下面讓我們了解一下。 數(shù)據(jù)地址[...
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學(xué)習(xí)筆記| RNA-seq之biomart基因注釋biomart是一個(gè)R package，能夠完成基因注釋的工作。在我得到差異表達(dá)基因之后，可以直接使用該包直接注釋。 網(wǎng)絡(luò)上許多代碼已經(jīng)過時(shí)，特此更新用法。 1 安裝 2 p...
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表達(dá)譜數(shù)據(jù)中相同基因如何處理在分析表達(dá)譜芯片的時(shí)候，我們經(jīng)常會(huì)遇到多個(gè)探針對(duì)應(yīng)同一個(gè)基因的情況。一般遇到這種情況，最常見的兩種處理方法是 1）取平均 2）取表達(dá)值高的那個(gè)探針 那么今天我們就用R來(lái)實(shí)現(xiàn)這...
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差異分析
差異基因的篩選方法 統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)得到p值 比方說你想研究什么基因，可以在全部都是腫瘤組織里面以某個(gè)基因分類，分成高表達(dá)和低表達(dá)的兩組，兩組數(shù)據(jù)進(jìn)行不配對(duì)t檢驗(yàn)或者anova方差分...
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R數(shù)據(jù)框如何取交集前面給大家介紹過了 ?R批量預(yù)測(cè)miRNA和靶基因之間的調(diào)控關(guān)系-ENCORI篇[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.wei...
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如何合并ESTIMATEScore和生存時(shí)間腫瘤微環(huán)境，腫瘤中免疫細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞的比例對(duì)預(yù)后有顯著影響，在腫瘤微環(huán)境中，免疫細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞是兩種主要類型的非腫瘤組分，并且研究表明對(duì)于腫瘤的診斷和預(yù)后評(píng)估具有重要價(jià)值。基...
