3010份亞洲稻群體重測序項目是由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所牽頭，聯(lián)合國際水稻研究所、華大基因等16家單位共同完成。該研究對來自89個國家的3,010份水稻品種進(jìn)行了重測序...
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IP屬地：湖南
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3K水稻SNP數(shù)據(jù)集的簡單利用 -
Dsuite: 從VCF文件中快速計算D-統(tǒng)計量和親緣相關(guān)性的工具
工具背景介紹 D統(tǒng)計量（也稱為ABBA-BABA統(tǒng)計量）和相關(guān)統(tǒng)計量通常用于評估種群或緊密相關(guān)物種之間的是否存在基因流。當(dāng)前計算D統(tǒng)計量的工具大多數(shù)都需要該工具自定義特定的文...
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Tajima's D 中性檢測的指標(biāo)
Tajima's D - Wikipedia[https://en.wikipedia.org/wiki/Tajima%27s_D] Tajima's D是由日本研究員田田文...
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「博客翻譯」SNP過濾教程（一）原文地址: SNP Filtering Tutorial 感覺文章寫的真棒，于是就翻譯了一遍 目標(biāo) 學(xué)習(xí)如何使用VCFtools根據(jù)缺失信息，基因型深度(genotype d...
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群體遺傳筆記（一）：群體間選擇信號的檢測及GO注釋從獲取下機(jī)數(shù)據(jù)做質(zhì)控、比對，到calling snp獲得vcf文件這一步，網(wǎng)上已經(jīng)有非常詳細(xì)的教程，有GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實踐（上），還有Samtools+bcf...
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群體遺傳學(xué)習(xí)筆記-基因型缺失數(shù)據(jù)的填充
Genotype Imputation是在高通量測序中常出現(xiàn)的定義，按照義譯就是基因型填充。要真正理解imputation這個概念，我們就需要先理解基因型缺失（genotyp...
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全基因組重測序基礎(chǔ)及高級分析知識匯總
轉(zhuǎn)自：http://www.360doc.com/content/18/0208/11/19913717_728563847.shtml 全基因組重測序是通過對已有參考序列（...
