寫在前面 以前總看到問題是,基因結構可視化的問題;現(xiàn)在則變成了啟動子元件的預測或者說可視化。這本身比較簡單,也比較玄乎,所以我一直不是太樂意與別人討論。但學院今天斷網,手上的...
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寫在前面 以前總看到問題是,基因結構可視化的問題;現(xiàn)在則變成了啟動子元件的預測或者說可視化。這本身比較簡單,也比較玄乎,所以我一直不是太樂意與別人討論。但學院今天斷網,手上的...
突然間發(fā)現(xiàn),我一做熱圖就用pheatmap幾乎不存在第二個選項了。是時候跑一遍pheatmap的demo了. Examples scale是一個值得注意的參數,它旨在說明你想...
BUSCO - 組裝質量評估軟件 BUSCO - Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs 額。直譯的話就是普遍通用的單拷貝直...
fastp是一款較新的數據質控軟件,接觸這個軟件也是由于目前市場的軟件各有功能但是功能都不是很全,譬如最近接觸到一個RNAseq數據,質量較差,需要去除接頭而且含N較多,序列...
KEGG pathway 注釋整理 獲得KEGG注釋 通過eggnog-mapper和interproscan兩個軟件(或數據庫),可以獲得KEGG ORTHOLOGY(KO...
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Bioconductor開發(fā)的物種注釋包系列集合了一個物種不同來源的注釋信息,能夠根據基因ID對其進行多種來源的注釋,比如說基因的別名,基因的功能等。 我之前也寫過一篇文章用...