1 背景 寫論文投稿的時(shí)候，對(duì)于引用文獻(xiàn)，期刊間要求不同。一些比較著名的期刊的引用格式在Endnote里可能已經(jīng)存在樣式模板，可以直接使用。那么不存在模板的就需要我們自己來自...
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自定義Endnote參考文獻(xiàn)引用格式 -
R數(shù)據(jù)可視化5:熱圖Heatmap最近休息了幾天。沒有來得及更新。今天我們來講一講熱圖怎么繪制 什么是熱圖(Heatmap) 熱圖是一個(gè)以顏色變化來顯示數(shù)據(jù)的矩陣。Toussaint Loua在1873年就曾...
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ROH、近交系數(shù)、親緣系數(shù)、IBD、IBS連續(xù)純合片段（runs of homozygosity, ROH）是親代將同源相同的單倍型傳遞給子代而形成的，基于ROH計(jì)算的基因組近交系數(shù)是個(gè)體真實(shí)的近交系數(shù)，它比傳統(tǒng)系譜...
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群體遺傳學(xué)統(tǒng)計(jì)指標(biāo)——種群核苷酸多樣性理論 種群核苷酸多樣性，顧名思義指的就是核苷酸多樣性，值越大說明核苷酸多樣性越高。通常用于衡量群體內(nèi)的核苷酸多樣性，也可以用來推演進(jìn)化關(guān)系。計(jì)算公式為： 計(jì)算群體的π值，可以...
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fastQC對(duì)RNA-seq質(zhì)控
FastQC - A high throughput sequence QC analysis tool fastqc安裝 1. 下載fastqc安裝包（http://www...
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fasta/fq文件處理萬能工具——Seqkit學(xué)習(xí)記錄
shenwei爪哥開發(fā)的處理Fasta/Fastq文件的萬能工具。之前處理fq/fa文件時(shí)花時(shí)間寫的一些腳本發(fā)現(xiàn)在seqkit里直接能一行命令就解決。實(shí)在是提升效率，整合流程...
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[基因組工具]seqkit的使用
SeqKit的學(xué)習(xí) --20191017 軟件的介紹 SeqKit是一種跨平臺(tái)的、極快的，全面的fasta/q處理工具。SeqKit為所有的主流操作系統(tǒng)提供了一種可執(zhí)行的雙元...
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單體型網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建——Haplotype Network基本概念 單體型：又稱單倍體型或單元型，是個(gè)體組織中，完全遺傳自父母雙方中某一親本的一組等位基因。擁有特定SNP的個(gè)體常常在附近某一特定變異位點(diǎn)擁有特定等位基因，這種關(guān)系叫做...
