看文獻的時候，發(fā)現(xiàn)了g:Profiler這個寶藏工具，測試了一下，使用起來超級方便、好用，一定要分享給大家~ g:Profiler網(wǎng)址： https://biit.cs.ut...
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批處理！功能富集分析、基因ID轉(zhuǎn)換、查找同源基因、SNP注釋一站式服務(wù)
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seqtk: fastq reads 隨機抽提
seqtk 用于隨機reads 抽提 安裝：conda install seqtk如果沒有安裝conda , 先安裝conda ,或者直接下載seqtk 安裝包，進行安裝 s...
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SRA Toolkit的使用和安裝從NCBI上下載SRA原始數(shù)據(jù)，使用SRA TOOLKIT 進行下載和轉(zhuǎn)化。 1. 下載SRA Toolkit （注意找準(zhǔn)自己的版本）https://trace.ncbi.n...
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「生信」共線性分析——MCScanX目錄MCScanX下載及安裝數(shù)據(jù)準(zhǔn)備MCScanX運行及結(jié)果Ka & Ks 計算下游畫圖腳本最后 MCScanX有兩個主要的功能, 一是, 方便使用者發(fā)現(xiàn)共線性(collin...
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「基因組注釋」使用RepeatModeler從頭注釋基因組的重復(fù)序列
RepeatModeler可用來從頭對基因組的重復(fù)序列家族進行建模注釋，它的核心組件是RECON和RepatScout。 使用方法 以擬南芥的參考基因組為例，假設(shè)基因組的名字...
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使用ggplot2個性化繪制GO富集分析柱狀圖好久沒更新了 今天就更新一波，今天的主題是如何使用ggplot2個性化繪制GO富集分析柱狀圖。進入正題,為什么選擇利用ggplot做圖，而沒用clusterProfiler自...
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如何用WGDI進行共線性分析(上)多倍化以及后續(xù)的基因丟失和二倍化現(xiàn)象存在于大部分的物種中, 是物種進化的重要動力。如果一個物種在演化過程中發(fā)生過多倍化，那么在基因組上就會存在一些共線性區(qū)域（即兩個區(qū)域之間的...
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使用Maxent最大熵模型模擬物種適生區(qū)操作步驟1.所需軟件： Maxent生態(tài)位模型軟件 (此軟件是用Java語言編寫的，需Java運行環(huán)境，請先去Java官網(wǎng)(http://java.com[https://link....
