示例數(shù)據(jù):GSE139324有63個(gè)samples。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE1393241...
復(fù)現(xiàn)文章:Analyses of metastasis-associated genes in IDH wild-type glioma數(shù)據(jù)來源:GSE84465圖1 數(shù)據(jù)篩...
大佬,geo單細(xì)胞數(shù)據(jù)給的很多都是raw,或者matrix 生信小白從第一步就卡住了??
掙扎中的生信菜鳥 評(píng)論自GEO單細(xì)胞數(shù)據(jù)讀取
scCancer包是2020年 清華大學(xué)Jin Gu團(tuán)隊(duì)開發(fā)的一個(gè)專門用于分析腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的工具包。它集成了單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的基本流程(Seurat),增添若干適合腫瘤數(shù)據(jù)...
@e0cb837cd5b9 您好我面臨一樣的問題,只有filtered_feature_bc_matrix(~1w cells)數(shù)據(jù),跑代碼報(bào)錯(cuò)Barcode file mising. 請(qǐng)問您說的“把raw文件夾刪除因?yàn)槟J(rèn)是有raw數(shù)據(jù)的”是指Barcode文件里混入了raw數(shù)據(jù)嗎?要怎么刪除這部分?jǐn)?shù)據(jù)呢
scCancer包:自動(dòng)分析腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組利器scCancer包是2020年 清華大學(xué)Jin Gu團(tuán)隊(duì)開發(fā)的一個(gè)專門用于分析腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的工具包。它集成了單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的基本流程(Seurat),增添若干適合腫瘤數(shù)據(jù)...