安裝配置conda 使用清華源下載sh腳本并安裝 下載完成后直接運(yùn)行腳本文件bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh。需要輸入yes然后等...
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這是最近趕的一個(gè) deadline 作品,之前答應(yīng)了 rOpenSci 投一個(gè) technote 小博文。因?yàn)椴荒苤貜?fù)包 Vignette 的內(nèi)容,所以本文我使用了生存分析這...
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為什么要做單細(xì)胞? 可以得到單個(gè)細(xì)胞的表達(dá)譜 可以發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞類型或者細(xì)胞狀態(tài)(這里面往往蘊(yùn)含著未知的生物學(xué)狀態(tài)或者過(guò)程) 識(shí)別細(xì)胞發(fā)育軌跡或者病變細(xì)胞發(fā)生發(fā)展進(jìn)程。 數(shù)據(jù)分...
數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換 data transfer,是將數(shù)據(jù)從一種表示形式變?yōu)榱硪环N表現(xiàn)形式的過(guò)程。我們喂給程序的數(shù)據(jù)在任何一個(gè)階段都要符合這個(gè)程序的數(shù)據(jù)要求,可視化也好,聚類也好,每一種...
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在TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)下載文件有很多種方法: 一.利用R語(yǔ)言下載(本文重點(diǎn)介紹這個(gè)) 方法1:TCGAbiolinks包(首推這個(gè)方法!!目前沒(méi)發(fā)現(xiàn)明顯缺點(diǎn)) 方法2:RTCGAT...
Seurat簡(jiǎn)介 ??Seurat[https://satijalab.org/seurat/]---幾乎是當(dāng)前單細(xì)胞RNA-seq分析領(lǐng)域的不可或缺的工具,特別是基于10X...