clusterProfiler包是Y叔開(kāi)發(fā)的一個(gè)強(qiáng)大的能進(jìn)行多種功能富集的R包，對(duì)于有OrgDb或AnnotationHub中收錄的物種進(jìn)行GO和KEGG的富集分析非常的方便...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：內(nèi)蒙古
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使用clusterProfiler包對(duì)非模式生物進(jìn)行GO和KEGG的富集分析
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cufflinks使用-2 (2018-05-29)
更多請(qǐng)了解Cufflinks: http://cole-trapnell-lab.github.io/cufflinks/ Cufflinks 利用Tophat比對(duì)的結(jié)果（a...
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RNA-seq：轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析處理（上）（2019/05/07更新）
superqun原創(chuàng) 一、流程概括 RNA-seq的原始數(shù)據(jù)（raw data）的質(zhì)量評(píng)估 linux環(huán)境和R語(yǔ)言環(huán)境 raw data的過(guò)濾和清除不可信數(shù)據(jù)（clean r...
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RNA-seq基因可變剪切分析
###因?yàn)間tf和fastq的對(duì)應(yīng)關(guān)系，從igenome上打包下載所有hg19的信息## 1. tophat2比對(duì) tophat2 -p 15 -G ../reference...
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RNA-seq練習(xí) 第二部分（基因組序列下載，注釋文件下載，索引下載，比對(duì)，比對(duì)質(zhì)控,HTseq-count計(jì)數(shù)，輸出count矩陣文件）參考基因組下載有三大全文網(wǎng)站提供參考基因組下載，它們分別是：1.NCBI （https://www.ncbi.nlm.nih.gov/grc）2.UCSC (http://h...
