質(zhì)控原則 好的結(jié)果需要好的數(shù)據(jù)。原始下機(jī)測序數(shù)據(jù)(raw data)中，有些reads包含有測序接頭序列，這些序列不屬于測序物種中的原有序列，因此質(zhì)控過程中需要剪切去除。同時...
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DNA甲基化分析②數(shù)據(jù)質(zhì)控 -
R包升級報錯成常態(tài),搜索告訴你。。。看到報錯不要怕，多試試一定會解決的，嘗試和搜索能力很重要。 背景： 有天不知道為什么，我升級了我的R包，從3.5.1到3.6.1，結(jié)果報錯就成了常態(tài)。在做RNA-seq差異分...
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如何正確理解菌群alpha-beta多樣性@(Dayueban)[腸道菌群|alpha多樣性|beta多樣性] 導(dǎo)讀 很多時候我們往往拿著現(xiàn)成的數(shù)據(jù)就開始分析了（因為有師兄師姐的代碼啊教程啊），或者干脆是公司測序和分...
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DNA甲基化分析④去重復(fù)＆計算胞嘧啶的甲基化值
1、去除冗余的reads 結(jié)果： 2、將bam文件轉(zhuǎn)化為sam文件 結(jié)果： 3、計算每個胞嘧啶的甲基化值 結(jié)果：
