融合轉錄本的產(chǎn)生 融合轉錄本由融合基因（DNA水平）或可變剪切事件產(chǎn)生（RNA水平）。 融合轉錄本的檢測術語 Figure 1. Figures to explain ter...
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融合轉錄本的檢測軟件對比（NGS） -
RNA-seq融合檢測軟件
STAR-Fusion 地址：Home · STAR-Fusion/STAR-Fusion Wiki · GitHub[https://github.com/STAR-Fus...
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單細胞轉錄組學習筆記-5-熟悉文獻作者提供的兩個表達矩陣劉小澤寫于19.6.17-第二單元第三講：熟悉文獻作者提供的兩個表達矩陣 筆記目的：根據(jù)生信技能樹的單細胞轉錄組課程探索smart-seq2技術相關的分析技術課程鏈接在：ht...
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基因組比對文件（SAM/BAM）中 Soft Clip 與 Hard Clip的含義描述Clip 的含義： Clip 作為名詞講，有剪下來的東西的意義，在SAM/BAM 比對文件里面，用于描述那些一條序列上，在序列兩端，比對不上的堿基序列（還是很形象的，一條上比...
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MGMT基因與膠質瘤治療因為需要對MGMT基因和膠質瘤的關系做生信分析，所以在這里收錄相關文獻總結和數(shù)據(jù)總結以便以后查看和更新，帖子最后附參考文獻鏈接 概述： MGMT作為早期被發(fā)現(xiàn)的化療敏感性相關...
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更新NT數(shù)據(jù)庫的二三事最近被要求更新一下NT數(shù)據(jù)庫，然后踩了好多坑，想記錄下來，避免以后再犯。 首先去官網(wǎng)上直接下載nt.fasta（wget -c ftp://ftp.ncbi.nlm.nih....
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Annovar注釋細節(jié)說明（一）Annovar注釋結果中Func.refGeneWithVer類型 annovar注釋結果中，一些列中的內容需要認真研究，如下是常用的信息： 注釋的優(yōu)先級如下： The va...
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一文讀懂SV檢測軟件Manta的結果文件Manta輸出VCF文件 Manta運行完畢后，將在$ {MANTA_ANALYSIS_PATH}/results/variants目錄下輸出一組VCF格式的結果文件。 如果...
