融合轉錄本的產(chǎn)生 融合轉錄本由融合基因(DNA水平)或可變剪切事件產(chǎn)生(RNA水平)。 融合轉錄本的檢測術語 Figure 1. Figures to explain ter...
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STAR-Fusion 地址:Home · STAR-Fusion/STAR-Fusion Wiki · GitHub[https://github.com/STAR-Fus...
劉小澤寫于19.6.17-第二單元第三講:熟悉文獻作者提供的兩個表達矩陣 筆記目的:根據(jù)生信技能樹的單細胞轉錄組課程探索smart-seq2技術相關的分析技術課程鏈接在:ht...
Clip 的含義: Clip 作為名詞講,有剪下來的東西的意義,在SAM/BAM 比對文件里面,用于描述那些一條序列上,在序列兩端,比對不上的堿基序列(還是很形象的,一條上比...
因為需要對MGMT基因和膠質瘤的關系做生信分析,所以在這里收錄相關文獻總結和數(shù)據(jù)總結以便以后查看和更新,帖子最后附參考文獻鏈接 概述: MGMT作為早期被發(fā)現(xiàn)的化療敏感性相關...
最近被要求更新一下NT數(shù)據(jù)庫,然后踩了好多坑,想記錄下來,避免以后再犯。 首先去官網(wǎng)上直接下載nt.fasta(wget -c ftp://ftp.ncbi.nlm.nih....
Annovar注釋結果中Func.refGeneWithVer類型 annovar注釋結果中,一些列中的內容需要認真研究,如下是常用的信息: 注釋的優(yōu)先級如下: The va...
Manta輸出VCF文件 Manta運行完畢后,將在$ {MANTA_ANALYSIS_PATH}/results/variants目錄下輸出一組VCF格式的結果文件。 如果...