前言 在繪圖時(shí)，如何搭配顏色，是一個(gè)很讓人頭疼的問題。今天要介紹的包 ggsci 能大大減輕我們的負(fù)擔(dān)。 ggsci 提供了很多高質(zhì)量的顏色搭配，其靈感來自于各種 SCI 雜...
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R 數(shù)據(jù)可視化 —— ggsci 配色 -
ggplot2-根據(jù)group給橫坐標(biāo)排序目標(biāo)：不受x軸變量名的影響，用group信息給橫坐標(biāo)進(jìn)行排序 數(shù)據(jù)表：variable（樣本名）；value（值，想畫箱線圖）；batch_melt（批次分類，即group）...
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conda環(huán)境報(bào)錯(cuò)： Solving environment: failed with initial frozen solve.
刷了機(jī)，安裝好conda環(huán)境后conda又瘋了。conda install -y samtools hisat2 bowtie2 bwa htseq bowtie報(bào)錯(cuò)開始 ...
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DoHeatmap的優(yōu)化+ComplexHeatmap繪制帶特定基因的單細(xì)胞熱圖單細(xì)胞繪圖系列： Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.itdecent.cn/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...
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單細(xì)胞分析實(shí)錄(13): inferCNV結(jié)合UPhyloplot2分析腫瘤進(jìn)化
這一個(gè)分析，我目前只在Nature Communications上面看到過兩篇文章，都是2020年發(fā)表的。腫瘤進(jìn)化是單細(xì)胞里面做腫瘤內(nèi)部異質(zhì)性一個(gè)比較創(chuàng)新的角度，我參與的課題...
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【單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組】UPhyloplot2繪制腫瘤進(jìn)化的系統(tǒng)發(fā)育樹目的：繪制腫瘤進(jìn)化的系統(tǒng)發(fā)育樹 參考文章 【官網(wǎng)】https://github.com/harbourlab/UPhyloplot2[https://github.com/h...
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單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實(shí)操軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 擬時(shí)間序列分析（Pseudot...
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環(huán)境配置筆記10-Monocle3的安裝
首先按照官網(wǎng)上的代碼進(jìn)行安裝 在最后一步安裝運(yùn)行以上兩行代碼時(shí)出現(xiàn)了問題： 使用yum在CentOS7上運(yùn)行： 仍然報(bào)錯(cuò)： yum沒有找到對應(yīng)依賴包，更新epel第三方軟件庫...
