作者,Evil Genius 關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組的整合分析已經(jīng)是非常常見(jiàn)了,昨天分享的是python版本,隨著數(shù)據(jù)量不斷地增大,R版本的計(jì)算效率明顯下降,但是作為一種更加具有接受...
作者,Evil Genius 關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組的整合分析已經(jīng)是非常常見(jiàn)了,昨天分享的是python版本,隨著數(shù)據(jù)量不斷地增大,R版本的計(jì)算效率明顯下降,但是作為一種更加具有接受...
MetaNeighbor/Documentation.md at master · gillislab/MetaNeighbor · GitHub[https://githu...
安裝官網(wǎng)中提到三種安裝方法,可通過(guò)conda, pip,git clone 安裝該軟件.我們這里利用conda,非常簡(jiǎn)單快速.1.1 conda創(chuàng)建環(huán)境 1.2 conda ...
Cell2location 是一個(gè)原則性的貝葉斯模型,它可以解析空間轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)中的細(xì)胞類型,并創(chuàng)建不同組織的全面細(xì)胞圖。Cell2location 解釋了變異的技術(shù)來(lái)源,并借用...
作者,追風(fēng)少年i 最近一直有人問(wèn)我空間轉(zhuǎn)錄組的餅圖該如何繪制,如下圖 之前呢,說(shuō)過(guò)一些,大家可以借鑒 10X空間轉(zhuǎn)錄組繪圖之細(xì)胞類型百分比餅圖和空間密度分布圖[https:/...
hello,又是周一,新的開(kāi)始,今天是二月二十八日,對(duì)于臺(tái)灣同胞來(lái)說(shuō)是一個(gè)沉重的日子,時(shí)間很快,快到我們毫無(wú)感覺(jué)就到了30歲,而立之年,這一篇我們進(jìn)行一下匯總,對(duì)單細(xì)胞空間聯(lián)...
不知道大家在研究單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合函數(shù)FindIntegrationAnchors[https://satijalab.org/seurat/reference/FindInte...
導(dǎo)讀 上一篇介紹了MetaPhlAn:宏基因組微生物分類分析教程[http://www.itdecent.cn/p/015cbdb80ce1],這次來(lái)學(xué)習(xí)MetaPhlAn...