作者，Evil Genius 關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組的整合分析已經(jīng)是非常常見(jiàn)了，昨天分享的是python版本，隨著數(shù)據(jù)量不斷地增大，R版本的計(jì)算效率明顯下降，但是作為一種更加具有接受...
IP屬地：華盛頓州
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課前準(zhǔn)備----空間轉(zhuǎn)錄組R版本的harmony整合（封裝版）
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Metaneighbor - 探究不同研究中的細(xì)胞亞類的相關(guān)性MetaNeighbor/Documentation.md at master · gillislab/MetaNeighbor · GitHub[https://githu...
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Fit-hic 2 通過(guò)hic數(shù)據(jù)檢測(cè)顯著性互作安裝官網(wǎng)中提到三種安裝方法，可通過(guò)conda, pip，git clone 安裝該軟件.我們這里利用conda,非常簡(jiǎn)單快速.1.1 conda創(chuàng)建環(huán)境 1.2 conda ...
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cell2location學(xué)習(xí)筆記Cell2location 是一個(gè)原則性的貝葉斯模型，它可以解析空間轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)中的細(xì)胞類型，并創(chuàng)建不同組織的全面細(xì)胞圖。Cell2location 解釋了變異的技術(shù)來(lái)源，并借用...
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10X空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之細(xì)胞百分比餅圖的繪制作者，追風(fēng)少年i 最近一直有人問(wèn)我空間轉(zhuǎn)錄組的餅圖該如何繪制，如下圖 之前呢，說(shuō)過(guò)一些，大家可以借鑒 10X空間轉(zhuǎn)錄組繪圖之細(xì)胞類型百分比餅圖和空間密度分布圖[https:/...
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10X單細(xì)胞空間聯(lián)合分析方法匯總及算法總結(jié)hello，又是周一，新的開(kāi)始，今天是二月二十八日，對(duì)于臺(tái)灣同胞來(lái)說(shuō)是一個(gè)沉重的日子，時(shí)間很快，快到我們毫無(wú)感覺(jué)就到了30歲，而立之年，這一篇我們進(jìn)行一下匯總，對(duì)單細(xì)胞空間聯(lián)...
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10X單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合分析Seurat之rpca（large data，細(xì)胞量超過(guò)20萬(wàn)）不知道大家在研究單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合函數(shù)FindIntegrationAnchors[https://satijalab.org/seurat/reference/FindInte...
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MetaPhlAn2宏基因組物種注釋導(dǎo)讀 上一篇介紹了MetaPhlAn：宏基因組微生物分類分析教程[http://www.itdecent.cn/p/015cbdb80ce1]，這次來(lái)學(xué)習(xí)MetaPhlAn...
個(gè)人介紹
不斷學(xué)習(xí)，不斷忘記，不斷回顧，不斷進(jìn)步，這便是凡人的學(xué)習(xí)方式,或謂曰：Attention is all you need,but learning is all your attention.