1. download monocle from https://www.bioconductor.org/packages/3.15/bioc/src/contrib/A...
發(fā)簡信
IP屬地：江西
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Monocle 2 中 orderCells () 報錯問題解決方法
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單細胞測序之差異表達基因獲得方法
1.加載數(shù)據(jù) 2.執(zhí)行默認的差異表達測試 Seurat 的大部分差異表達特征可以通過“FindMarkers()”函數(shù)訪問。 默認情況下，Seurat 基于非參數(shù) Wilco...
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學(xué)習(xí)CellChat細胞間通訊分析2學(xué)習(xí) CellChat 細胞間通訊分析 第一部分：CellChat對象的數(shù)據(jù)輸入&處理及初始化 [Reference] (https://github.com/sqjin/C...
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自學(xué)單細胞筆記自學(xué)單細胞筆記 認識sce object [參考文獻]https://www.researchgate.net/publication/332045971_Orchestra...
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TCGA——數(shù)據(jù)整理（FPKM到TPM）
0.安裝包 1、下載好HTseq-FPKM的TCGA數(shù)據(jù) 2、將所有文件夾下的壓縮包復(fù)制到一個文件夾下 3、解壓縮到同一文件夾#gunzip()函數(shù) 4、提取藏在metada...
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RTCGA學(xué)習(xí)-指定基因在不同癌癥的表達量學(xué)習(xí)代碼引自生信技能樹https://mp.weixin.qq.com/s/JB_329LCWqo5dY6MLawfEA 1.安裝加載RTCGA：R包 2.指定基因HSF1從癌癥...
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學(xué)習(xí)小組Day6-ksprings
一、R包安裝加載 1. 鏡像 options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) ...
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學(xué)習(xí)小組54期 6th day-R package--忍冬2020-04-22 今日內(nèi)容： 學(xué)習(xí)R包“R包使用是一通百通”--突然之間有了信心 以dplyr為例，講一下R包 安裝和加載R包1.1 鏡像設(shè)置 你還在每次配置Rstudi...
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學(xué)習(xí)小組-day5-Mingwei Guo：R基礎(chǔ)學(xué)習(xí)1.向量 2.從向量中提取元素 根據(jù)元素位置 根據(jù)元素的值 3.讀取文本 4.設(shè)置行名和列名 5.數(shù)據(jù)框的導(dǎo)出 6. #變量的保存與重新加載 7.提取元素 Tips 將數(shù)據(jù)框...
