單細(xì)胞測(cè)序方法和原理系列： 1. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組建庫(kù)原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[http://www.itdecent.cn/p/6c5d...
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單細(xì)胞免疫組庫(kù)：TCR基因重排原理和TCR測(cè)序建庫(kù)方法 -
使用mixcr構(gòu)建免疫組庫(kù)及下游分析免疫組庫(kù)（Immune Repertoire，IR）是指?jìng)€(gè)體在某個(gè)特定時(shí)間其循環(huán)系統(tǒng)中所有多樣性的T細(xì)胞和B細(xì)胞的總和，即V(D)J序列多樣性的集合。免疫組庫(kù)分析是指運(yùn)用高通...
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10× Genomics單細(xì)胞免疫組庫(kù)VDJ分析必知必會(huì)我們生活著的世界并非只有我們自己，而是有很多小于或大于我們的生物不斷與我們交互著，有的讓我們開(kāi)心，有的使我們傷心。這就關(guān)系到一個(gè)本質(zhì)的問(wèn)題： 我是誰(shuí)？ 我是一個(gè)腦袋，一個(gè)軀體...
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CellChat三部曲1：使用CellChat對(duì)單個(gè)數(shù)據(jù)集進(jìn)行細(xì)胞間通訊分析CellChat三部曲1：使用CellChat對(duì)單個(gè)數(shù)據(jù)集進(jìn)行細(xì)胞間通訊分析 自從周運(yùn)來(lái)在簡(jiǎn)書(shū)寫(xiě)了一篇cellchat的中文介紹教程，然后R包作者也在B站做了直播介紹，cel...
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用ggplot2畫(huà)代謝集富集分析（MSEA）圖MSEA 什么是MSEA MSEA，Metabolite Set Enrichment Analysis，代謝集富集分析，是代謝組數(shù)據(jù)分析方法的一種。MSEA是基因集富集分析...
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rmats2sashimiplot安裝及使用作用：二代數(shù)據(jù)用rmats-turbo跑完之后得到各exon的五種可變剪切事件和count數(shù)，用ramts2sashimiplot可視化。github網(wǎng)址：https://g...
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【10X空間轉(zhuǎn)錄組Visium】（三）跑通Visium全流程記錄舊號(hào)無(wú)故被封，小號(hào)再發(fā)一次 更多空間轉(zhuǎn)錄組文章： 1. 新版10X Visium 【10X空間轉(zhuǎn)錄組Visium】（一）Space Ranger 1.0.0(更新于20191...
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強(qiáng)化學(xué)習(xí)基礎(chǔ)知識(shí)詳解強(qiáng)化學(xué)習(xí)（Reinforcement Learning） 強(qiáng)化學(xué)習(xí)基本概念 強(qiáng)化學(xué)習(xí)四要素：狀態(tài)(state)、動(dòng)作(action)、策略（policy）、獎(jiǎng)勵(lì)(reward...
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AI數(shù)學(xué)基礎(chǔ)18——常見(jiàn)的正則化方法1，L2 regularization（權(quán)重衰減）L2正則化就是在代價(jià)函數(shù)后面再加上一個(gè)正則化項(xiàng)λ ，使得權(quán)重在更新的時(shí)候，乘以一個(gè)小于1的因子（1-a(λ/m))，這個(gè)可以...
