近日，做差異分析的時(shí)候，想著看一下樣本本身的特征是以什么分類的，除了計(jì)算樣本之間的距離，還用到的PCA（主成分分析）。在DESeq2包中專門由一個(gè)PCA分析的函數(shù)，即plot...
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DESeq2 PCA 的一些問題 -
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選擇VirtualBox的原因、Linux虛擬機(jī)的正確設(shè)置本文寫于2021年03月21日，閱讀時(shí)請注意時(shí)效，動(dòng)筆時(shí)VirtualBox的最新版本為6.1.32，本文中使用這一版本。 本文是GPU集群管理、使用指南[https://w...
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⑥??[目錄]目錄⑥生信在線課程推薦：技能樹/基因課/生信人/生信自學(xué)網(wǎng)等1.目錄①轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)資源整合 2.目錄②生物信息學(xué)相關(guān)博客、論壇、公眾號(hào)推薦 3.目錄③來自于生信技能樹和生信菜鳥團(tuán)的待刷的生信題目目錄 4.目錄④生信相關(guān)的優(yōu)質(zhì)workfl...
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5分鐘讓你明白“軟鏈接”和“硬鏈接”的區(qū)別
今天在知乎上看到一篇十分有趣的問題：如何評價(jià)微軟高級(jí)工程師癡迷于soft link這一linux常見概念？ 雖然又是知名撕逼王曾某的撕逼帖，但是我還是想就題目中鏈接的問題簡單...
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2020-11-08 SRA上那些奇怪的10x Genomics數(shù)據(jù)寫這個(gè)記錄的緣由，是我在生信技能樹[https://wemp.app/accounts/9b0e20f5-631b-40f3-8f16-4bdb30bc9753]上看到這樣一...
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傾向性評分匹配完整實(shí)例（R實(shí)現(xiàn)）傾向性評分匹配（propensity score matching, PSM）主要是在隨機(jī)對照試驗(yàn)(Randomized controlled trials,RCT)中用于衡...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial同系列文章： sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[http://www.itdecent.cn/p...
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SingleR輔助注釋單細(xì)胞很多做單細(xì)胞的研究者都提出過這個(gè)問題，是否有直接的功能能對單細(xì)胞直接進(jìn)行注釋，而不是繁瑣的參看文獻(xiàn)，搜索marker，人為對單細(xì)胞進(jìn)行注釋。單細(xì)胞真的可以實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化注釋嗎？我...
